PIGS基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
PIGS基因编码磷脂酰肌醇N-乙酰葡糖胺转移酶亚基S,参与GPI锚生物合成,其突变与遗传性糖基磷脂酰肌醇缺乏症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PIGS |
|---|---|
| 基因全名 | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class S |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17p13.2 |
| NCBI Gene ID | 94005 ncbi.nlm.nih.gov/gene/94005 |
| Ensembl ID | ENSG00000108798 |
| UniProt ID | Q96S52 |
| OMIM ID | 610274 |
| HGNC ID | 14937 |
| 基因别名 | FLJ22329 |
基因功能与研究简介
PIGS基因编码磷脂酰肌醇N-乙酰葡糖胺转移酶(GPI-GnT)的亚基S,该酶复合物催化GPI锚生物合成的第一步。GPI锚是许多细胞表面蛋白附着到质膜的重要结构,参与信号转导、细胞粘附等过程。PIGS基因突变可导致GPI锚合成缺陷,引发遗传性糖基磷脂酰肌醇缺乏症(GPIBD),表现为神经系统发育异常、癫痫、智力障碍等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性糖基磷脂酰肌醇缺乏症 | PIGS基因突变导致GPI锚生物合成障碍,影响多种GPI锚定蛋白的表达和功能,进而引起多系统发育异常,尤其是神经系统。 | 已明确致病 |
| 癫痫 | 部分PIGS突变患者表现为癫痫发作,可能与神经元GPI锚定蛋白功能异常有关。 | 具有较强研究证据 |
| 智力障碍 | PIGS突变导致的GPI锚缺陷可影响神经发育,导致智力障碍。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.200delA (p.Asn67fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PIGS基因突变通常导致功能丧失,因为GPI锚生物合成需要完整的PIGS蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PIGS突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PIGS突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000506 (glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthetic process) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) |
相关通路
• Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis (hsa00563)
蛋白质功能简介
PIGS蛋白是GPI-GnT复合物的亚基之一,该复合物催化GPI锚生物合成的第一步,即将N-乙酰葡糖胺转移到磷脂酰肌醇上。PIGS蛋白位于内质网膜,可能参与复合物的稳定性和催化活性。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|