PIH1D2基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱
PIH1D2是PIH1结构域蛋白家族成员,参与核糖体生物发生和细胞增殖调控,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PIH1D2 |
|---|---|
| 基因全名 | PIH1 domain containing 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q13.4 |
| NCBI Gene ID | 120379 ncbi.nlm.nih.gov/gene/120379 |
| Ensembl ID | ENSG00000137710 |
| UniProt ID | Q9H0W9 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 24991 |
| 基因别名 | FLJ20643, MGC131944 |
基因功能与研究简介
PIH1D2(PIH1 domain containing 2)是PIH1结构域蛋白家族成员,该家族蛋白参与核糖体生物发生、细胞周期调控和DNA损伤应答等过程。PIH1D2在多种组织中表达,尤其在睾丸和某些肿瘤中高表达。研究表明,PIH1D2可能通过调控核糖体RNA加工和细胞增殖参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | PIH1D2在多种癌症中表达异常,可能通过影响核糖体生物发生和细胞增殖促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 暂无明确致病性突变 | 目前尚无PIH1D2直接导致遗传性疾病的明确证据。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA-seq) |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 表达水平各异 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.S152F) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.789delC (p.L263fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变(Loss of Function):移码突变等导致蛋白功能缺失,可能影响核糖体生物发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变(Gain of Function):目前暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005730 nucleolus | • GO:0006364 rRNA processing |
| • GO:0005515 protein binding |
相关通路
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
• rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
PIH1D2蛋白包含PIH1结构域,该结构域参与蛋白质-蛋白质相互作用。PIH1D2定位于核仁,参与核糖体RNA的加工和核糖体生物发生。研究表明,PIH1D2可能通过与含H/ACA snoRNP复合物相互作用,调控rRNA的假尿苷化修饰。此外,PIH1D2在细胞增殖和肿瘤发生中可能发挥重要作用。