PIPOX基因|基因功能、疾病关联、突变与代谢研究
PIPOX基因编码脯氨酸氧化酶,参与脯氨酸代谢,与高脯氨酸血症及癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PIPOX |
|---|---|
| 基因全名 | pipecolic acid and sarcosine oxidase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q11.2 |
| NCBI Gene ID | 51268 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51268 |
| Ensembl ID | ENSG00000108771 |
| UniProt ID | Q9P0Z9 |
| OMIM ID | 605826 |
| HGNC ID | 17843 |
| 基因别名 | L-pipecolate oxidase, LPI, PECI, SCOT |
基因功能与研究简介
PIPOX基因编码脯氨酸氧化酶(pipecolic acid and sarcosine oxidase),该酶参与L-脯氨酸的分解代谢,催化L-脯氨酸氧化为Δ1-吡咯啉-5-羧酸。该酶还参与L-哌啶酸和肌氨酸的代谢。PIPOX基因突变可导致高脯氨酸血症(hyperprolinemia)和肌氨酸血症(sarcosinemia)。此外,PIPOX在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或代谢调节因子。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 高脯氨酸血症 | PIPOX基因突变导致脯氨酸氧化酶活性降低或缺失,引起脯氨酸代谢障碍,导致血液中脯氨酸水平升高。 | 已明确致病 |
| 肌氨酸血症 | PIPOX基因突变影响肌氨酸代谢,导致肌氨酸在血液中积累。 | 已明确致病 |
| 癌症 | PIPOX在多种癌症中表达下调或缺失,可能通过影响脯氨酸代谢和氧化还原平衡参与肿瘤发生发展。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白质截短,功能丧失 |
| c.200A>G (p.Asp67Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PIPOX基因的失功能突变(如无义突变、移码突变)导致脯氨酸氧化酶活性降低或缺失,引起代谢障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PIPOX存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PIPOX存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004733 (L-proline oxidase activity) | • GO:0005739 (mitochondrion) |
| • GO:0006561 (proline catabolic process) | • GO:0009060 (aerobic respiration) |
相关通路
• Proline metabolism (Reactome: R-HSA-70614)
• Sarcosine metabolism (Reactome: R-HSA-70614)
蛋白质功能简介
PIPOX编码的脯氨酸氧化酶是一种线粒体酶,属于黄素蛋白氧化酶家族。该酶以FAD为辅因子,催化L-脯氨酸氧化为Δ1-吡咯啉-5-羧酸,同时产生过氧化氢。该酶也参与L-哌啶酸和肌氨酸的氧化。PIPOX在肝脏和肾脏中高表达,在脑组织中也有表达。其活性受底物浓度和激素调节。