PKD1L1基因|基因功能、疾病关联、突变与多囊肾病研究
PKD1L1基因编码纤毛相关蛋白,参与左右轴建立,其突变与常染色体隐性多囊肾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PKD1L1 |
|---|---|
| 基因全名 | polycystin 1 like 1 (transient receptor potential channel interacting) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7p12.3 |
| NCBI Gene ID | 340061 ncbi.nlm.nih.gov/gene/340061 |
| Ensembl ID | ENSG00000158683 |
| UniProt ID | Q8N5M9 |
| OMIM ID | 609721 |
| HGNC ID | 21716 |
| 基因别名 | PC1L1, PKD1L, FLJ32670 |
基因功能与研究简介
PKD1L1基因编码多囊蛋白1样蛋白1,属于多囊蛋白家族,与PKD1具有相似性。该蛋白定位于初级纤毛,参与左右轴建立和心脏发育。PKD1L1突变可导致常染色体隐性多囊肾病(ARPKD)样表型,以及内脏异位(situs inversus)等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性多囊肾病(ARPKD) | PKD1L1突变导致纤毛功能异常,影响肾小管发育,引起囊肿形成。 | 已明确致病 |
| 内脏异位(situs inversus) | PKD1L1参与左右轴建立,突变可导致内脏反转。 | 已明确致病 |
| 先天性心脏病 | PKD1L1突变可能影响心脏左右不对称发育,导致先天性心脏病。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 肾上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 成纤维细胞 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.4567_4568del (p.Leu1523fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.7890G>A (p.Trp2630Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致蛋白截短或降解,影响纤毛功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005929 (cilium) | • GO:0001947 (heart looping) |
| • GO:0007368 (determination of left/right symmetry) |
相关通路
• HPO:0000118 (Cystic kidney disease)
• HPO:0001640 (Situs inversus totalis)
蛋白质功能简介
PKD1L1蛋白包含信号肽、多个PKD结构域、跨膜区和胞内C端,与PKD1类似。该蛋白定位于初级纤毛,参与机械感觉和信号转导,对左右轴建立至关重要。