PKD2基因|多囊肾病关键基因、功能、突变与疾病关联
PKD2基因编码多囊蛋白-2,其突变是常染色体显性多囊肾病(ADPKD)的主要病因之一,参与钙信号调控和肾小管形态发生。
基因信息卡
| 基因符号 | PKD2 |
|---|---|
| 基因全名 | Polycystin-2 (PC2), Transient Receptor Potential Cation Channel, Subfamily P, Member 2 (TRPP2) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q22.1 |
| NCBI Gene ID | 5311 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5311 |
| Ensembl ID | ENSG00000118762 |
| UniProt ID | Q13563 |
| OMIM ID | 173910 |
| HGNC ID | 9009 |
| 基因别名 | PC2, TRPP2, PKD4, AUTS14 |
基因功能与研究简介
PKD2基因编码多囊蛋白-2(Polycystin-2),属于瞬时受体电位(TRP)通道家族,是一种非选择性阳离子通道,主要定位于内质网、纤毛和质膜。PKD2与PKD1编码的多囊蛋白-1(Polycystin-1)形成复合物,参与机械感觉、钙信号调控和肾小管形态发生。PKD2基因突变是常染色体显性多囊肾病(ADPKD)的主要病因之一,约占ADPKD病例的15%。此外,PKD2突变还与胰腺和肝脏囊肿、血管异常(如颅内动脉瘤)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体显性多囊肾病(ADPKD) | PKD2基因突变导致多囊蛋白-2功能丧失,破坏肾小管上皮细胞钙信号通路,促进囊肿形成和扩张。 | 已明确致病 |
| 胰腺囊肿 | PKD2突变可导致胰腺导管扩张和囊肿形成,但通常无症状。 | 具有较强研究证据 |
| 肝脏囊肿 | PKD2突变可导致肝内胆管囊肿,但通常无症状。 | 具有较强研究证据 |
| 颅内动脉瘤 | PKD2突变增加颅内动脉瘤风险,可能因血管平滑肌细胞钙信号异常。 | 具有较强研究证据 |
| 其他血管异常 | 包括主动脉根部扩张、冠状动脉瘤等,与PKD2突变相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 血管平滑肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 肾上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 血管平滑肌细胞 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胆管上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胰腺导管上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1264C>T (p.Arg422Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1831C>T (p.Arg611Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2146C>T (p.Arg716Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2764G>A (p.Gly922Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
| c.2923C>T (p.Arg975Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
| c.2965C>T (p.Arg989Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3100C>T (p.Arg1034Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3112C>T (p.Arg1038Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3124C>T (p.Arg1042Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3133C>T (p.Arg1045Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PKD2基因突变导致多囊蛋白-2功能丧失,包括无义突变、移码突变和剪接位点突变,导致蛋白截短或降解,破坏钙通道功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PKD2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型多囊蛋白-2的功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005261 (cation channel activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0005929 (cilium) | • GO:0006811 (ion transport) |
| • GO:0006812 (cation transport) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0007600 (sensory perception) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0035556 (intracellular signal transduction) | • GO:0042995 (cell projection) |
| • GO:0055085 (transmembrane transport) |
相关通路
• Calcium signaling pathway (KEGG: hsa04020)
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
• Signaling by GPCR (Reactome: R-HSA-372790)
• Cilium assembly (Reactome: R-HSA-5617833)
蛋白质功能简介
多囊蛋白-2(Polycystin-2)是一种非选择性阳离子通道,属于TRP通道家族。它由968个氨基酸组成,具有六个跨膜结构域,N端和C端均位于胞质侧。多囊蛋白-2主要定位于内质网、纤毛和质膜,与多囊蛋白-1形成复合物,参与机械感觉、钙信号调控和肾小管形态发生。PKD2基因突变导致多囊蛋白-2功能丧失,是常染色体显性多囊肾病(ADPKD)的主要病因之一。
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