PKD2L1基因|基因功能、疾病关联、突变与多囊肾病研究

PKD2L1基因编码一种非选择性阳离子通道蛋白,参与钙信号调控,与多囊肾病及味觉感知相关。

基因信息卡

基因符号 PKD2L1
基因全名 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel
基因类型 protein coding
染色体位置 10q24.31
NCBI Gene ID 9031 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9031
Ensembl ID ENSG00000107593
UniProt ID Q9NZM5
OMIM ID 604064
HGNC ID 9018
基因别名 PKDL, PKD2L, TRPP3

基因功能与研究简介

PKD2L1基因编码多囊蛋白2样1蛋白,属于瞬时受体电位(TRP)通道家族。该蛋白形成非选择性阳离子通道,主要通透钙离子,参与细胞内钙信号调控。PKD2L1在多种组织中表达,尤其在肾脏、心脏和味觉感受细胞中发挥重要作用。研究表明,PKD2L1与多囊肾病(PKD)的发病机制相关,但其具体作用尚不完全清楚。此外,PKD2L1在酸味感知中起关键作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
多囊肾病 PKD2L1突变可能影响通道功能,导致钙信号异常,参与肾囊肿形成。但PKD2L1与常染色体显性多囊肾病(ADPKD)的关联证据有限,可能为潜在关联。 ClinVar, OMIM
味觉障碍 PKD2L1在酸味感受细胞中表达,其功能障碍可能导致味觉异常。 UniProt, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
味蕾 暂无可靠数据 高表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用于异源表达研究
肾上皮细胞 暂无可靠数据 内源性表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Cys) 错义突变 罕见 可能影响通道功能,与多囊肾病相关(证据有限)
c.456delA (p.Lys152fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致通道活性降低或蛋白表达异常,可能影响钙信号传导。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:可能干扰正常PKD2L1通道功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005261 (cation channel activity) • GO:0006816 (calcium ion transport)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

Calcium signaling pathway (KEGG: hsa04020)
Taste transduction (KEGG: hsa04742)

蛋白质功能简介

PKD2L1蛋白由764个氨基酸组成,包含六个跨膜结构域,形成功能性阳离子通道。该通道对钙离子具有通透性,参与细胞内钙稳态的调节。PKD2L1在肾脏中可能参与纤毛功能调控,其突变可能导致多囊肾病。此外,PKD2L1在味蕾中作为酸味受体,介导酸味感知。

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