PKN1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PKN1编码蛋白激酶N1,参与细胞信号转导、细胞骨架调控和细胞凋亡,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PKN1
基因全名 protein kinase N1
基因类型 protein coding
染色体位置 19p13.12
NCBI Gene ID 5585 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5585
Ensembl ID ENSG00000123143
UniProt ID Q16512
OMIM ID 601648
HGNC ID 9405
基因别名 PRK1, PKN, PAK1, PKN-1, MGC46222

基因功能与研究简介

PKN1(蛋白激酶N1)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,属于PKC相关激酶家族。它参与多种细胞过程,包括细胞骨架重塑、细胞迁移、凋亡和信号转导。PKN1通过其N端的HR1结构域与Rho家族小GTP酶相互作用,并被脂质如磷脂酰肌醇4,5-二磷酸激活。PKN1在多种组织中表达,尤其在脑和心脏中高表达。研究表明PKN1在肿瘤发生、神经退行性疾病和心血管疾病中发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 PKN1在多种癌症中表达异常,可能通过调控细胞增殖、凋亡和迁移参与肿瘤发生。 较强研究证据
神经退行性疾病 PKN1参与tau蛋白磷酸化,可能与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 潜在关联
心血管疾病 PKN1在心脏中高表达,可能参与心肌肥厚和心力衰竭的病理过程。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响激酶活性
c.2345C>T (p.Arg782Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.3456del (p.Gln1152ArgfsTer5) 移码突变 罕见 可能导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致PKN1激酶活性降低或蛋白表达缺失,可能影响细胞信号传导和细胞骨架调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,增强PKN1激酶活性或改变底物特异性,可能促进细胞增殖或迁移。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰野生型PKN1的功能,可能通过竞争性结合或形成无活性二聚体实现。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity) • GO:0005524 (ATP binding)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0007165 (signal transduction) • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization)

相关通路

Rho GTPase signaling pathway (Reactome: R-HSA-194840)
Apoptosis (Reactome: R-HSA-109581)
Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)

蛋白质功能简介

PKN1蛋白由942个氨基酸组成,包含N端的HR1a、HR1b和HR1c结构域,以及C端的激酶结构域。HR1结构域介导与Rho GTPase的相互作用,激酶结构域负责磷酸化底物。PKN1的活性受脂质和磷酸化调控。它参与多种信号通路,包括Rho介导的细胞骨架重塑和凋亡信号。PKN1的异常表达或突变与多种疾病相关,是潜在的药物靶点。

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