PKP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PKP1基因编码桥粒斑蛋白,参与细胞间黏附,其突变与皮肤和心脏疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PKP1
基因全名 Plakophilin 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q32.1
NCBI Gene ID 5317 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5317
Ensembl ID ENSG00000081277
UniProt ID Q13835
OMIM ID 601975
HGNC ID 9023
基因别名 B6P; FLJ00079; MGC117215; MGC138683

基因功能与研究简介

PKP1基因编码桥粒斑蛋白1(Plakophilin 1),属于臂板蛋白家族,是桥粒的结构组分。桥粒是细胞间黏附连接,在皮肤和心肌等组织中尤为重要。PKP1蛋白参与桥粒的组装和稳定,对维持组织完整性至关重要。PKP1基因突变可导致皮肤和心脏疾病,如外胚层发育不良/皮肤脆弱综合征(EDSS)和致心律失常性右心室心肌病(ARVC)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
外胚层发育不良/皮肤脆弱综合征(EDSS) PKP1基因突变导致桥粒结构异常,影响皮肤细胞间黏附,导致皮肤脆弱、掌跖角化、毛发稀疏等。 已明确致病
致心律失常性右心室心肌病(ARVC) PKP1基因突变可能影响心肌细胞间黏附,导致心肌结构异常和心律失常。 具有较强研究证据
皮肤鳞状细胞癌 PKP1表达下调可能促进肿瘤侵袭和转移,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
食管 暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HaCaT 暂无可靠数据 角质形成细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
AC16 暂无可靠数据 心肌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1132C>T (p.Arg378Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,破坏桥粒结构
c.1366G>A (p.Gly456Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠或相互作用,功能影响待验证
c.2035delC (p.Leu679TrpfsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PKP1基因的截短突变(如无义突变、移码突变)导致蛋白功能丧失,破坏桥粒结构,是EDSS的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PKP1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰正常蛋白功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0005913 (cell-cell junction)
• GO:0005882 (intermediate filament) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (WP
KEGG)
Desmosome assembly (Reactome)

蛋白质功能简介

PKP1蛋白是桥粒斑蛋白家族的成员,主要表达于上皮组织和心肌。它参与桥粒的组装和稳定,通过与其他桥粒蛋白(如桥粒芯蛋白、桥粒胶蛋白)相互作用,连接中间丝,维持细胞间黏附。PKP1的缺失或突变会导致桥粒结构异常,影响组织完整性,导致皮肤和心脏疾病。

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