PLEKHM1基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞自噬研究

PLEKHM1是调控自噬体和溶酶体融合的关键衔接蛋白,其突变与骨硬化症和神经退行性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PLEKHM1
基因全名 Pleckstrin Homology and RUN Domain Containing M1
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q21.31
NCBI Gene ID 9842 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9842
Ensembl ID ENSG00000141560
UniProt ID Q9Y4H2
OMIM ID 611466
HGNC ID 29036
基因别名 KIAA0350, B2

基因功能与研究简介

PLEKHM1(Pleckstrin Homology and RUN Domain Containing M1)基因编码一种衔接蛋白,在自噬体与溶酶体融合过程中发挥关键作用。该蛋白包含RUN结构域和PH结构域,能够与Rab7、LC3等蛋白相互作用,调控自噬流和溶酶体功能。PLEKHM1突变与常染色体隐性遗传的骨硬化症(osteopetrosis)相关,并可能参与神经退行性疾病的发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨硬化症(Osteopetrosis) PLEKHM1突变导致自噬和溶酶体功能异常,影响破骨细胞功能,导致骨吸收障碍,引起骨硬化。 已明确致病(OMIM 611466)
神经退行性疾病(Neurodegenerative diseases) PLEKHM1在神经元自噬中起重要作用,其功能异常可能导致自噬障碍,与阿尔茨海默病等疾病相关。 具有较强研究证据(PMID: 27462458)
癌症(Cancer) PLEKHM1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控自噬影响肿瘤进展,但具体机制尚不明确。 潜在关联(PMID: 31586006)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1120C>T (p.Arg374Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失
c.1486G>A (p.Gly496Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能受损
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使PLEKHM1无法正常介导自噬体-溶酶体融合,导致自噬障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明PLEKHM1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明PLEKHM1突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005776 autophagosome
• GO:0005764 lysosome • GO:0016239 positive regulation of autophagosome maturation
• GO:0006914 autophagy

相关通路

Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
Mitophagy (Reactome: R-HSA-5205647)

蛋白质功能简介

PLEKHM1蛋白包含RUN结构域和PH结构域,定位于自噬体和溶酶体膜。它通过同时结合LC3和Rab7,促进自噬体与溶酶体的融合。此外,PLEKHM1还参与破骨细胞中的囊泡运输,影响骨吸收。其功能异常与骨硬化症和神经退行性疾病相关。

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