PLEKHM2基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究

PLEKHM2编码含普列克斯特林同源结构域的衔接蛋白,参与自噬体-溶酶体融合及内体运输,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 PLEKHM2
基因全名 pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p36.21
NCBI Gene ID 23207 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23207
Ensembl ID ENSG00000116786
UniProt ID Q8IWE4
OMIM ID 609613
HGNC ID 29117
基因别名 KIAA0729, SKIP

基因功能与研究简介

PLEKHM2(含普列克斯特林同源结构域的M家族成员2)编码一种衔接蛋白,参与自噬体-溶酶体融合和内体运输。该蛋白包含RUN结构域和PH结构域,通过与Rab7、HOPS复合物等相互作用调控自噬流。PLEKHM2在多种组织中表达,尤其在脑和心脏中丰富。其功能异常与神经发育障碍和心肌病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 PLEKHM2突变导致蛋白功能丧失,影响自噬和神经元发育,与常染色体隐性遗传的神经发育障碍相关。 ClinVar, OMIM
扩张型心肌病 PLEKHM2突变可能影响心肌细胞自噬,导致心肌病,但证据有限。 ClinVar, 文献

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.456_457del (p.Glu153fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白截短或降解,丧失功能,影响自噬和神经元发育。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005768 endosome
• GO:0005776 autophagosome • GO:0006914 autophagy
• GO:0016192 vesicle-mediated transport

相关通路

Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
Endocytosis (KEGG: hsa04144)

蛋白质功能简介

PLEKHM2蛋白包含RUN结构域和PH结构域,定位于内体和自噬体。它作为衔接蛋白,与Rab7和HOPS复合物相互作用,促进自噬体与溶酶体的融合。此外,PLEKHM2还参与内体运输和细胞信号传导。其功能异常与神经发育障碍和心肌病相关。

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