PLEKHM2基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
PLEKHM2编码含普列克斯特林同源结构域的衔接蛋白,参与自噬体-溶酶体融合及内体运输,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PLEKHM2 |
|---|---|
| 基因全名 | pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.21 |
| NCBI Gene ID | 23207 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23207 |
| Ensembl ID | ENSG00000116786 |
| UniProt ID | Q8IWE4 |
| OMIM ID | 609613 |
| HGNC ID | 29117 |
| 基因别名 | KIAA0729, SKIP |
基因功能与研究简介
PLEKHM2(含普列克斯特林同源结构域的M家族成员2)编码一种衔接蛋白,参与自噬体-溶酶体融合和内体运输。该蛋白包含RUN结构域和PH结构域,通过与Rab7、HOPS复合物等相互作用调控自噬流。PLEKHM2在多种组织中表达,尤其在脑和心脏中丰富。其功能异常与神经发育障碍和心肌病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | PLEKHM2突变导致蛋白功能丧失,影响自噬和神经元发育,与常染色体隐性遗传的神经发育障碍相关。 | ClinVar, OMIM |
| 扩张型心肌病 | PLEKHM2突变可能影响心肌细胞自噬,导致心肌病,但证据有限。 | ClinVar, 文献 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.456_457del (p.Glu153fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致蛋白截短或降解,丧失功能,影响自噬和神经元发育。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005768 endosome |
| • GO:0005776 autophagosome | • GO:0006914 autophagy |
| • GO:0016192 vesicle-mediated transport |
相关通路
• Autophagy - animal (KEGG: hsa04140)
• Endocytosis (KEGG: hsa04144)
蛋白质功能简介
PLEKHM2蛋白包含RUN结构域和PH结构域,定位于内体和自噬体。它作为衔接蛋白,与Rab7和HOPS复合物相互作用,促进自噬体与溶酶体的融合。此外,PLEKHM2还参与内体运输和细胞信号传导。其功能异常与神经发育障碍和心肌病相关。