PLOD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PLOD1编码赖氨酰羟化酶1,参与胶原蛋白交联,其突变导致埃勒斯-当洛斯综合征(EDS)VI型。
基因信息卡
| 基因符号 | PLOD1 |
|---|---|
| 基因全名 | procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.22 |
| NCBI Gene ID | 5351 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5351 |
| Ensembl ID | ENSG00000083444 |
| UniProt ID | Q02809 |
| OMIM ID | 153454 |
| HGNC ID | 9081 |
| 基因别名 | LH1, LLH, PLOD, LH4 |
基因功能与研究简介
PLOD1基因编码赖氨酰羟化酶1(LH1),该酶催化胶原蛋白中赖氨酸残基的羟基化,是胶原蛋白交联的关键步骤。PLOD1突变导致埃勒斯-当洛斯综合征VI型(EDS VI型),一种罕见的结缔组织疾病,以皮肤过度伸展、关节活动过度、组织脆性增加和脊柱侧凸为特征。PLOD1在多种组织中表达,尤其在骨骼、皮肤和肌腱中高表达。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 埃勒斯-当洛斯综合征VI型(EDS VI型) | PLOD1基因突变导致LH1酶活性降低或缺失,影响胶原蛋白交联,导致结缔组织结构异常。 | 已明确致病 |
| 脊柱侧凸 | EDS VI型常见表现,由结缔组织异常导致。 | 已明确致病 |
| 骨质疏松 | 部分EDS VI型患者出现骨密度降低,可能与胶原异常有关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肌腱 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 成纤维细胞 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 成骨细胞 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1378C>T (p.Arg460Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1081C>T (p.Arg361Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1850G>A (p.Gly617Asp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致LH1酶活性降低或缺失,影响胶原蛋白交联。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005506 (iron ion binding) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0009791 (post-embryonic development) | • GO:0016491 (oxidoreductase activity) |
| • GO:0016702 (oxidoreductase activity | • acting on single donors with incorporation of molecular oxygen |
| • incorporation of two atoms of oxygen) | • GO:0030199 (collagen fibril organization) |
| • GO:0046872 (metal ion binding) | • GO:0055114 (oxidation-reduction process) |
相关通路
• Collagen biosynthesis and modifying enzymes (R-HSA-1650814)
• Collagen formation (R-HSA-1474290)
• Extracellular matrix organization (R-HSA-1474244)
蛋白质功能简介
PLOD1编码的赖氨酰羟化酶1(LH1)是一种同源四聚体酶,定位于内质网,催化胶原蛋白中Y位置的赖氨酸残基羟基化,形成羟基赖氨酸,随后参与糖基化和交联。LH1对胶原蛋白的稳定性和功能至关重要。PLOD1突变导致LH1活性降低,影响胶原蛋白交联,导致结缔组织疾病。