PLOD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PLOD3编码赖氨酰羟化酶3,参与胶原蛋白交联,其突变可导致骨发育不良和结缔组织疾病。

基因信息卡

基因符号 PLOD3
基因全名 procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q22.1
NCBI Gene ID 8985 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8985
Ensembl ID ENSG00000106348
UniProt ID O60568
OMIM ID 603066
HGNC ID 9083
基因别名 LH3; MGC138455

基因功能与研究简介

PLOD3基因编码赖氨酰羟化酶3(LH3),属于2-酮戊二酸依赖性双加氧酶家族。该酶催化胶原蛋白中赖氨酸残基的羟基化,是胶原蛋白交联的关键步骤。PLOD3在多种组织中表达,尤其在骨骼和结缔组织中高表达。PLOD3突变可导致骨发育不良和结缔组织疾病,如Bruck综合征和骨脆性-白内障-关节松弛综合征。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Bruck综合征 PLOD3突变导致胶原蛋白交联异常,影响骨基质形成,导致骨质疏松和关节挛缩。 已明确致病
骨脆性-白内障-关节松弛综合征 PLOD3突变影响胶原蛋白成熟,导致骨骼脆性增加、白内障和关节松弛。 已明确致病
结缔组织疾病 PLOD3突变可能影响胶原蛋白结构和功能,导致结缔组织异常。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HUVEC 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2053C>T (p.Arg685Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1082G>A (p.Gly361Asp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变导致蛋白截短,丧失酶活性,影响胶原蛋白交联。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005506 (iron ion binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0016702 (oxidoreductase activity • acting on paired donors
• with incorporation or reduction of molecular oxygen) • GO:0019797 (procollagen-lysine 5-dioxygenase activity)
• GO:0030199 (collagen fibril organization) • GO:0046872 (metal ion binding)

相关通路

Collagen biosynthesis and modifying enzymes (R-HSA-1650814)
Lysine catabolism (R-HSA-71291)

蛋白质功能简介

PLOD3蛋白(UniProt O60568)属于赖氨酰羟化酶家族,含有Fe2+和2-酮戊二酸结合位点。该蛋白定位于内质网,催化胶原蛋白中赖氨酸残基的羟基化,形成羟基赖氨酸,进而参与胶原蛋白交联。PLOD3的突变可导致酶活性降低或丧失,影响胶原蛋白成熟,导致结缔组织疾病。

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