PLS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PLS1编码plastin 1,参与肌动蛋白捆绑,在听觉毛细胞和肠道中高表达,与听力损失和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PLS1 |
|---|---|
| 基因全名 | plastin 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q23 |
| NCBI Gene ID | 5357 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5357 |
| Ensembl ID | ENSG00000120756 |
| UniProt ID | Q14651 |
| OMIM ID | 602734 |
| HGNC ID | 9097 |
| 基因别名 | PLSN; Fimbrin |
基因功能与研究简介
PLS1基因编码plastin 1(又称fimbrin),属于肌动蛋白捆绑蛋白家族。该蛋白在细胞骨架重塑中发挥关键作用,尤其在听觉毛细胞和肠道微绒毛中高表达。PLS1通过捆绑肌动蛋白丝维持细胞结构的稳定性,参与细胞运动、粘附及信号转导。研究表明,PLS1突变与常染色体隐性非综合征性听力损失(DFNB76)相关,并在多种肿瘤中异常表达,影响肿瘤进展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性非综合征性听力损失(DFNB76) | PLS1突变导致蛋白功能丧失,影响听觉毛细胞肌动蛋白束的完整性,导致感音神经性听力损失。 | 已明确致病(OMIM) |
| 结直肠癌 | PLS1在结直肠癌中表达上调,可能通过促进细胞迁移和侵袭参与肿瘤进展。 | 具有较强研究证据(PMID: 23455005) |
| 乳腺癌 | PLS1在乳腺癌中表达异常,与预后相关,可能通过调节细胞骨架影响肿瘤转移。 | 潜在关联(PMID: 25605242) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 高表达(UniProt) |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 高表达(UniProt) |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达(UniProt) |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达(UniProt) |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达(UniProt) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Caco-2 | 暂无可靠数据 | 结直肠腺癌细胞系,内源性表达PLS1 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,表达PLS1 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系,可用于外源表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1336C>T (p.Arg446Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失,与DFNB76相关 |
| c.1156G>A (p.Gly386Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能,与DFNB76相关 |
| c.1045C>T (p.Arg349Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响肌动蛋白结合,与DFNB76相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失,是DFNB76的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PLS1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PLS1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003779 (actin binding) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005856 (cytoskeleton) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0030027 (lamellipodium) |
| • GO:0030863 (cortical cytoskeleton) | • GO:0042470 (melanosome) |
| • GO:0070062 (extracellular exosome) |
相关通路
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
• Fc gamma R-mediated phagocytosis (KEGG: hsa04666)
• Tight junction (KEGG: hsa04530)
蛋白质功能简介
PLS1编码的plastin 1蛋白含有两个EF-hand钙结合域和两个肌动蛋白结合域,以钙依赖方式捆绑肌动蛋白丝。该蛋白在听觉毛细胞中形成肌动蛋白束,对机械感觉毛束的完整性至关重要;在肠道微绒毛中维持刷状缘结构。PLS1还参与细胞迁移和粘附,其表达异常与肿瘤侵袭转移相关。