PML基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PML基因编码早幼粒细胞白血病蛋白,是PML核体的关键组分,参与肿瘤抑制、细胞凋亡、DNA损伤应答等多种重要生物学过程。

基因信息卡

基因符号 PML
基因全名 promyelocytic leukemia
基因类型 protein coding
染色体位置 15q24.1
NCBI Gene ID 5371 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5371
Ensembl ID ENSG00000140464
UniProt ID P29590
OMIM ID 102578
HGNC ID 9113
基因别名 MYL, PP867, RNF71, TRIM19

基因功能与研究简介

PML基因编码早幼粒细胞白血病蛋白(PML蛋白),属于三结构域蛋白家族(TRIM)成员。PML蛋白是PML核体(PML nuclear bodies, PML-NBs)的核心组分,参与调控细胞凋亡、细胞周期、DNA损伤应答、转录调控、抗病毒防御等多种重要生物学过程。PML基因最初在急性早幼粒细胞白血病(APL)中发现,与RARA基因发生融合,形成PML-RARA融合蛋白,导致APL的发生。PML蛋白具有E3泛素连接酶活性,参与多种蛋白的泛素化修饰。此外,PML蛋白在肿瘤抑制中发挥重要作用,其表达水平在多种肿瘤中下调。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性早幼粒细胞白血病 PML基因与RARA基因发生染色体易位t(15;17)(q22;q21),形成PML-RARA融合基因,编码融合蛋白,抑制维甲酸受体信号通路,阻断粒细胞分化,导致APL。 已明确致病
急性髓系白血病 PML基因突变或表达异常可能参与AML的发生,但证据尚不充分。 潜在关联
实体瘤 PML蛋白表达下调或缺失在多种实体瘤中观察到,可能促进肿瘤进展,但具体机制尚在研究中。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 PML在骨髓中表达,但具体nTPM数据暂无可靠来源
外周血 暂无可靠数据 PML在白细胞中表达,但具体nTPM数据暂无可靠来源
肝脏 暂无可靠数据 PML在肝脏中表达,但具体nTPM数据暂无可靠来源
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
NB4 暂无可靠数据 APL细胞系,表达PML-RARA融合蛋白
HL-60 暂无可靠数据 早幼粒细胞白血病细胞系,PML表达正常
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系,PML表达正常
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
PML-RARA融合 染色体易位 APL中约95%以上 功能获得(Gain of Function):融合蛋白抑制维甲酸信号,阻断分化
PML基因点突变 错义突变 罕见 功能缺失(Loss of Function):可能影响PML核体形成或蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PML基因的失活突变(如点突变导致蛋白功能丧失)可能削弱PML的肿瘤抑制功能,促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

PML-RARA融合蛋白是一种功能获得性突变,获得抑制维甲酸受体信号和阻断粒细胞分化的新功能。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

PML-RARA融合蛋白可能通过显性负效应干扰野生型PML和RARA的功能,但具体机制尚需进一步研究。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005730 nucleolus • GO:0005813 centrosome
• GO:0006915 apoptotic process • GO:0006974 DNA damage response
• GO:0008270 zinc ion binding • GO:0016567 protein ubiquitination
• GO:0042802 identical protein binding • GO:0045892 negative regulation of transcription
• DNA-templated

相关通路

hsa04115 p53 signaling pathway
hsa04210 Apoptosis
hsa05200 Pathways in cancer
hsa05202 Transcriptional misregulation in cancer

蛋白质功能简介

PML蛋白是一种多结构域蛋白,包含RING finger、B-box、coiled-coil和SUMO化位点。PML蛋白是PML核体的核心组分,通过招募多种蛋白(如p53、DAXX、SP100等)参与调控细胞凋亡、DNA损伤应答、转录调控等过程。PML蛋白具有E3泛素连接酶活性,可促进靶蛋白的泛素化降解。PML蛋白的SUMO化修饰对其核体形成和功能至关重要。在APL中,PML-RARA融合蛋白破坏PML核体结构,导致PML功能丧失,从而促进白血病发生。

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