POLK基因|DNA聚合酶κ功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

POLK编码DNA聚合酶κ,参与跨损伤DNA合成,对基因组稳定性至关重要,其突变与多种癌症风险相关。

基因信息卡

基因符号 POLK
基因全名 DNA polymerase kappa
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q13.3
NCBI Gene ID 51426 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51426
Ensembl ID ENSG00000122034
UniProt ID Q9UBT6
OMIM ID 605275
HGNC ID 9183
基因别名 DINB1, POLQ, FLJ37997

基因功能与研究简介

POLK基因编码DNA聚合酶κ,属于Y家族DNA聚合酶,参与跨损伤DNA合成(TLS),能够绕过多种DNA损伤,如鸟嘌呤氧化损伤和苯并[a]芘加合物。POLK在维持基因组稳定性中发挥重要作用,其功能异常与多种癌症风险增加相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症风险 POLK基因的遗传变异可能影响个体对致癌物诱导的DNA损伤的易感性,从而增加癌症风险。 较强研究证据
结直肠癌 POLK基因的某些单核苷酸多态性(SNPs)与结直肠癌风险相关。 较强研究证据
肺癌 POLK基因的变异可能影响吸烟相关DNA损伤的修复,与肺癌风险相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
A549 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HCT116 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs3213801 SNP 人群频率约0.2 可能影响POLK表达或活性,与癌症风险相关
rs5744533 SNP 人群频率约0.1 可能影响POLK功能,与肺癌风险相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致POLK蛋白活性降低或丧失,可能增加DNA损伤积累,促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):增强POLK的催化活性或改变其底物特异性,可能增加突变频率,但具体证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负效突变):突变型POLK可能干扰野生型蛋白的功能,但目前在POLK中证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• DNA polymerase activity (GO:0003887) • DNA binding (GO:0003677)
• nucleotide binding (GO:0000166) • DNA repair (GO:0006281)
• translesion synthesis (GO:0019985) • nucleus (GO:0005634)

相关通路

Translesion synthesis (TLS) pathway (Reactome: R-HSA-5656165)
DNA damage bypass (KEGG: hsa03430)

蛋白质功能简介

POLK编码的DNA聚合酶κ属于Y家族聚合酶,具有独特的底物特异性,能高效绕过鸟嘌呤氧化损伤(如8-oxoG)和苯并[a]芘二醇环氧化物加合物。POLK在细胞核中定位,参与DNA复制和修复过程。其活性受多种蛋白调控,如PCNA和REV1。POLK的异常表达或突变与多种癌症风险相关,使其成为潜在的药物靶点。

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