POLR1C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POLR1C是RNA聚合酶I和III共有的关键亚基,其突变导致Treacher Collins综合征和白细胞发育不良,是核糖体生物发生和转录调控的重要研究靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | POLR1C |
|---|---|
| 基因全名 | RNA polymerase I and III subunit C |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 6p21.1 |
| NCBI Gene ID | 9533 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9533 |
| Ensembl ID | ENSG00000131844 |
| UniProt ID | O15160 |
| OMIM ID | 610060 |
| HGNC ID | 17268 |
| 基因别名 | RPA40, RPC40, AC40, RPAC1 |
基因功能与研究简介
POLR1C基因编码RNA聚合酶I和RNA聚合酶III共有的亚基,是核糖体RNA(rRNA)和多种小RNA(如tRNA、5S rRNA)转录所必需的。该蛋白参与聚合酶复合物的组装和稳定性,对核糖体生物发生和细胞生长至关重要。POLR1C突变可导致常染色体隐性遗传的Treacher Collins综合征(TCS)和白细胞发育不良(Leukodystrophy, hypomyelinating, 11型)。此外,POLR1C在多种癌症中表达异常,可能作为潜在的治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Treacher Collins综合征 | POLR1C突变导致RNA聚合酶I/III功能受损,影响神经嵴细胞增殖和存活,导致颅面发育异常。 | 已明确致病(OMIM 248390) |
| 白细胞发育不良(Hypomyelinating leukodystrophy 11) | POLR1C突变影响RNA聚合酶III介导的tRNA转录,导致髓鞘形成障碍。 | 已明确致病(OMIM 616494) |
| 癌症 | POLR1C在多种肿瘤中高表达,可能通过促进核糖体生物发生支持肿瘤细胞增殖。 | 具有较强研究证据(COSMIC) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白功能丧失 |
| c.334C>T (p.Arg112*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.853C>T (p.Arg285Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数POLR1C突变导致功能丧失,包括无义突变、移码突变和剪接位点突变,导致蛋白截短或降解,影响RNA聚合酶I/III复合物的组装和功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明POLR1C存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型蛋白的功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (GO:0003899) | • RNA polymerase I complex (GO:0005736) |
| • RNA polymerase III complex (GO:0005666) | • nucleolus (GO:0005730) |
| • rRNA transcription (GO:0009303) | • tRNA transcription (GO:0042797) |
相关通路
• RNA polymerase I promoter opening (R-HSA-73728)
• RNA polymerase III transcription (R-HSA-74160)
• rRNA processing (R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
POLR1C蛋白(UniProt O15160)是RNA聚合酶I和III的共有亚基,分子量约40 kDa。该蛋白包含一个N端α-螺旋结构域和一个C端β-折叠结构域,参与聚合酶复合物的组装和与DNA的结合。POLR1C在核仁中定位,与POLR1D形成异二聚体,是聚合酶I和III催化核心的组成部分。该蛋白对rRNA和tRNA的转录至关重要,其功能异常可导致核糖体生物发生障碍和细胞增殖缺陷。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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