POLR2E基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POLR2E编码RNA聚合酶II亚基E,是转录机制的核心组成部分,对基因表达调控至关重要。
基因信息卡
| 基因符号 | POLR2E |
|---|---|
| 基因全名 | RNA polymerase II, I and III subunit E |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.3 |
| NCBI Gene ID | 5434 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5434 |
| Ensembl ID | ENSG00000099817 |
| UniProt ID | P19388 |
| OMIM ID | 180662 |
| HGNC ID | 9199 |
| 基因别名 | RPB5, XAP4, hRPB25, hsRPB5 |
基因功能与研究简介
POLR2E基因编码RNA聚合酶II亚基E(RPB5),是RNA聚合酶II全酶的组成部分,参与转录起始和延伸过程。该亚基在聚合酶复合物的组装和稳定性中发挥关键作用,并可能参与DNA修复和细胞周期调控。POLR2E的突变与某些癌症和发育异常相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | POLR2E突变可能影响转录调控,导致基因表达异常,促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | POLR2E突变可能影响神经发育相关基因的表达,导致智力障碍等。 | 潜在关联 |
| 癌症相关 | POLR2E在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤标志物或治疗靶点。 | 癌症相关 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质结构,导致功能异常 |
| c.200delA (p.Asn67ThrfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白质截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变:导致POLR2E蛋白功能缺失或降低,可能影响RNA聚合酶II活性,进而影响基因表达。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明POLR2E存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:可能产生异常蛋白,干扰正常POLR2E功能,但具体证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003899 (DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity) | • GO:0006366 (transcription by RNA polymerase II) |
| • GO:0005665 (RNA polymerase II | • core complex) |
| • GO:0006351 (transcription | • DNA-templated) |
相关通路
• hsa03020 (RNA polymerase)
• hsa03022 (Basal transcription factors)
• hsa05034 (Alcoholism)
蛋白质功能简介
POLR2E编码的蛋白质是RNA聚合酶II的亚基E(RPB5),分子量约为25 kDa。该亚基在聚合酶复合物的组装中起关键作用,并参与转录起始和延伸。RPB5还可能与DNA修复和细胞周期调控相关。蛋白质结构包含一个保守的N端结构域和一个C端结构域,后者可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|