POLR2F基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POLR2F是RNA聚合酶II核心亚基,参与转录调控,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | POLR2F |
|---|---|
| 基因全名 | RNA polymerase II, I and III subunit F |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q13.1 |
| NCBI Gene ID | 5435 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5435 |
| Ensembl ID | ENSG00000100142 |
| UniProt ID | P61218 |
| OMIM ID | 604414 |
| HGNC ID | 9193 |
| 基因别名 | RPB6, POLR2F, RPB6, hRPB6 |
基因功能与研究简介
POLR2F基因编码RNA聚合酶II、I和III的共享亚基F(RPB6),是RNA聚合酶II全酶的组成部分,参与转录起始和延伸过程。该亚基对于聚合酶的组装和稳定性至关重要,并可能参与调控基因表达。POLR2F的突变与神经发育障碍相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | POLR2F突变可能导致RNA聚合酶II功能异常,影响基因转录,进而干扰神经发育。 | ClinVar |
| 智力障碍 | 部分POLR2F突变与智力障碍相关,证据来自临床病例。 | ClinVar |
| 发育迟缓 | 有报道POLR2F突变与发育迟缓相关。 | ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.337C>T (p.Arg113Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.404G>A (p.Arg135His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致提前终止密码子,产生截短蛋白,可能丧失功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (GO:0003899) | • RNA polymerase II complex (GO:0005665) |
| • nucleus (GO:0005634) | • transcription (GO:0006351) |
相关通路
• RNA polymerase II transcription (Reactome: R-HSA-73857)
• RNA polymerase II transcription initiation (Reactome: R-HSA-75955)
蛋白质功能简介
POLR2F蛋白是RNA聚合酶II的亚基F,分子量约14 kDa,参与聚合酶复合物的组装和稳定性。该蛋白在转录过程中与DNA和RNA相互作用,对转录活性至关重要。其突变可能导致聚合酶功能异常,影响基因表达。