POLR2L基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POLR2L是RNA聚合酶II复合物的核心亚基,对基因转录至关重要,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | POLR2L |
|---|---|
| 基因全名 | RNA polymerase II, I and III subunit L |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 9p21.1 |
| NCBI Gene ID | 5441 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5441 |
| Ensembl ID | ENSG00000177700 |
| UniProt ID | P62875 |
| OMIM ID | 606606 |
| HGNC ID | 9195 |
| 基因别名 | RPABC5, RPB10, RPB10beta, RPB7alpha, hRPB7a |
基因功能与研究简介
POLR2L基因编码RNA聚合酶II、I和III的共享亚基L(RPABC5),是RNA聚合酶II复合物的核心组分,参与DNA转录过程。该亚基对于聚合酶的组装和稳定性至关重要,并可能参与转录调控。POLR2L的突变与神经发育障碍相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | POLR2L基因突变可能导致RNA聚合酶II功能异常,影响基因表达,进而导致神经发育异常。 | ClinVar中有致病性变异记录,但具体机制尚不明确。 |
| 癌症 | POLR2L在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生,但证据尚不充分。 | COSMIC数据库中有体细胞突变记录,但频率较低,功能影响未明。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失。 |
| c.2T>C (p.Met1Thr) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失。 |
| c.3G>A (p.Met1Ile) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变:导致POLR2L蛋白功能缺失或降低,可能影响RNA聚合酶II的组装和活性,进而影响转录过程。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明POLR2L存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明POLR2L存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (GO:0003899) | • RNA polymerase II complex (GO:0005665) |
| • nucleus (GO:0005634) | • transcription |
| • DNA-templated (GO:0006351) |
相关通路
• RNA polymerase II transcription (Reactome: R-HSA-73857)
• RNA Polymerase II Transcription Initiation (Reactome: R-HSA-75953)
蛋白质功能简介
POLR2L蛋白是RNA聚合酶II复合物的一个亚基,分子量约为7.5 kDa。该蛋白在进化上高度保守,对于聚合酶的组装和稳定性至关重要。它可能参与转录起始和延伸过程,并与其他亚基相互作用。POLR2L的突变可能导致聚合酶功能异常,进而影响基因表达。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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