POLR3F基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POLR3F是RNA聚合酶III的关键亚基,参与多种小RNA的转录,其突变与神经系统发育障碍和肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | POLR3F |
|---|---|
| 基因全名 | RNA polymerase III subunit F |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 20q11.22 |
| NCBI Gene ID | 10621 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10621 |
| Ensembl ID | ENSG00000132664 |
| UniProt ID | Q9H1D9 |
| OMIM ID | 617455 |
| HGNC ID | 30082 |
| 基因别名 | RPC39, RPC6, POLR3F |
基因功能与研究简介
POLR3F基因编码RNA聚合酶III(Pol III)的一个亚基,该酶负责合成tRNA、5S rRNA、U6 snRNA等小RNA。POLR3F是Pol III复合物的核心组分,对转录起始和延伸至关重要。研究表明,POLR3F突变可导致Pol III功能异常,进而影响细胞生长和分化,与神经系统发育障碍和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脑白质营养不良 | POLR3F突变导致Pol III功能受损,影响髓鞘形成,导致神经系统退行性病变。 | OMIM |
| 肝细胞癌 | POLR3F在肝癌中表达上调,可能通过促进Pol III转录活性促进肿瘤增殖。 | COSMIC |
| 结直肠癌 | POLR3F突变或表达异常与结直肠癌的发生发展相关。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.337C>T (p.Arg113Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.1000G>A (p.Glu334Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白与DNA结合,导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致POLR3F蛋白功能丧失或降低,影响Pol III转录活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (GO:0003899) | • RNA polymerase III complex (GO:0005666) |
| • nucleus (GO:0005634) | • transcription |
| • DNA-templated (GO:0006351) |
相关通路
• RNA polymerase III transcription (Reactome: R-HSA-76071)
• tRNA processing (Reactome: R-HSA-72306)
蛋白质功能简介
POLR3F蛋白是RNA聚合酶III复合物的亚基之一,分子量约39 kDa。该蛋白包含一个保守的RNA聚合酶结构域,参与DNA结合和转录起始。POLR3F与其他亚基共同组装成Pol III复合物,在细胞核内催化小RNA的合成。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|