POP4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

POP4是核糖核酸酶P复合物的核心亚基,参与tRNA前体加工,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 POP4
基因全名 POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.33
NCBI Gene ID 10767 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10767
Ensembl ID ENSG00000105607
UniProt ID O95707
OMIM ID 606113
HGNC ID 17650
基因别名 RPP29, RNaseP 29kDa subunit

基因功能与研究简介

POP4基因编码核糖核酸酶P(RNase P)和核糖核酸酶MRP(RNase MRP)复合物的一个亚基。该蛋白是RNase P和RNase MRP的RNA加工复合体的组成部分,参与tRNA前体5'端加工和线粒体DNA复制等过程。POP4在细胞核和线粒体中均有定位,其功能异常可能与多种疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
软骨毛发发育不全 POP4基因突变可能导致RNase MRP复合物功能异常,影响核糖体RNA加工和细胞周期调控,与软骨毛发发育不全(Cartilage-Hair Hypoplasia, CHH)相关。 OMIM
癌症 POP4在多种癌症中表达异常,可能通过影响tRNA加工和核糖体生物发生参与肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确。 COSMIC
线粒体疾病 POP4参与线粒体DNA复制,其突变可能影响线粒体功能,与线粒体疾病相关,但证据有限。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾上腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.215G>A (p.Arg72His) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.262C>T (p.Arg88Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致POP4蛋白功能丧失或减弱,可能影响RNase P/MRP复合物活性,导致tRNA加工异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明POP4存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明POP4存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004526 (ribonuclease P activity) • GO:0005654 (nucleoplasm)
• GO:0005739 (mitochondrion) • GO:0008033 (tRNA processing)
• GO:0030684 (preribosome)

相关通路

核糖核酸酶P复合物通路 (RNase P complex pathway)
tRNA加工通路 (tRNA processing pathway)

蛋白质功能简介

POP4蛋白是核糖核酸酶P(RNase P)和核糖核酸酶MRP(RNase MRP)复合物的一个亚基,分子量约为29 kDa。该蛋白包含一个RNA结合结构域,参与复合物的组装和RNA底物的识别。POP4在细胞核中参与tRNA前体5'端加工,在线粒体中参与线粒体DNA复制。其表达水平在多种组织中存在,但具体表达模式尚需进一步研究。

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