POPDC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

POPDC1(Popeye域含蛋白1)是心脏和骨骼肌中高表达的膜蛋白,参与心脏电传导和肌肉功能调控,其突变与心脏疾病相关。

基因信息卡

基因符号 POPDC1
基因全名 Popeye domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q21
NCBI Gene ID 339562 ncbi.nlm.nih.gov/gene/339562
Ensembl ID ENSG00000112210
UniProt ID Q9BZV1
OMIM ID 614098
HGNC ID 25923
基因别名 POP1, POPDC1, BVES, POP-1

基因功能与研究简介

POPDC1(Popeye domain containing 1)基因编码一种含有Popeye结构域的膜蛋白,主要在心脏和骨骼肌中高表达。该蛋白参与心脏电传导、肌肉发育和功能调控,以及细胞间通讯。POPDC1突变与遗传性心脏病(如病态窦房结综合征)和肌肉疾病相关。研究表明,POPDC1在维持心脏节律和肌肉完整性中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
病态窦房结综合征 POPDC1突变导致蛋白功能异常,影响心脏起搏细胞的电活动,导致窦房结功能障碍。 已明确致病
骨骼肌发育异常 POPDC1在骨骼肌中高表达,突变可能影响肌肉发育和再生,但具体机制尚在研究中。 具有较强研究证据
癌症相关 部分研究提示POPDC1在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达或未检测
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
心肌细胞 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌细胞 暂无可靠数据 高表达
其他细胞系 暂无可靠数据 低表达或未检测
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.259C>T (p.Arg87Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能丧失或显性负效应
c.412G>A (p.Gly138Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白定位或功能,与病态窦房结综合征相关
c.574_575del (p.Leu192fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,失去正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明POPDC1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效应突变,如错义突变可能干扰正常蛋白功能,但具体机制需进一步研究。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0006811 (ion transport) • GO:0008016 (regulation of heart contraction)
• GO:0007512 (skeletal muscle development)

相关通路

hsa04260 (Cardiac muscle contraction)
hsa05414 (Dilated cardiomyopathy)
hsa05410 (Hypertrophic cardiomyopathy)

蛋白质功能简介

POPDC1蛋白含有Popeye结构域,是一种跨膜蛋白,主要定位于细胞膜。在心脏和骨骼肌中高表达,参与调节心脏电传导和肌肉功能。研究表明,POPDC1可能通过与其他蛋白相互作用,影响离子通道活性或细胞信号传导。其突变可导致蛋白功能异常,进而引发心脏和肌肉疾病。

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