POPDC3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
POPDC3(Popeye域含3)基因编码的蛋白在心脏和骨骼肌中高表达,参与心肌细胞电生理和机械应力感知,其突变与心肌病和肌营养不良相关。
基因信息卡
| 基因符号 | POPDC3 |
|---|---|
| 基因全名 | Popeye domain containing 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q21 |
| NCBI Gene ID | 64208 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64208 |
| Ensembl ID | ENSG00000132465 |
| UniProt ID | Q9HBV1 |
| OMIM ID | 605824 |
| HGNC ID | 17651 |
| 基因别名 | POP3, POPDC3, bA55J14.1 |
基因功能与研究简介
POPDC3基因编码Popeye域包含蛋白3,属于Popeye域蛋白家族。该蛋白在心脏和骨骼肌中高表达,参与心肌细胞的电生理调节和机械应力感知。研究表明,POPDC3与cAMP信号通路相关,可能通过结合cAMP调节心脏功能。POPDC3突变与常染色体隐性遗传的肢带型肌营养不良和扩张型心肌病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肢带型肌营养不良 | POPDC3基因突变导致蛋白功能丧失,影响肌肉细胞膜稳定性,导致肌纤维损伤和进行性肌无力。 | 已明确致病 |
| 扩张型心肌病 | POPDC3突变影响心肌细胞电生理和结构,导致心脏扩大和收缩功能下降。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 心肌细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.391C>T (p.Arg131Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.575G>A (p.Trp192Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.826C>T (p.Arg276Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致蛋白截短或降解,影响其正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0008013 (beta-catenin binding) |
| • GO:0030552 (cAMP binding) |
相关通路
• cAMP signaling pathway (Reactome: R-HSA-418555)
• Cardiac conduction (Reactome: R-HSA-5576891)
蛋白质功能简介
POPDC3蛋白属于Popeye域蛋白家族,包含一个保守的Popeye域,可能参与cAMP结合。该蛋白在心脏和骨骼肌中高表达,定位于细胞膜和细胞质,参与心肌细胞的电生理调节和机械应力感知。研究表明,POPDC3与cAMP信号通路相关,可能通过调节离子通道活性影响心脏功能。