PPIL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PPIL1编码肽基脯氨酰异构酶样1,参与前体mRNA剪接和蛋白质折叠,其突变与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PPIL1 |
|---|---|
| 基因全名 | peptidylprolyl isomerase like 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 6p21.1 |
| NCBI Gene ID | 51645 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51645 |
| Ensembl ID | ENSG00000112210 |
| UniProt ID | Q9Y3C6 |
| OMIM ID | 606209 |
| HGNC ID | 28913 |
| 基因别名 | PPIL1, CYPJ, PPIase, hCyPJ |
基因功能与研究简介
PPIL1基因编码肽基脯氨酰异构酶样1蛋白,属于亲环蛋白家族,具有肽基脯氨酰异构酶活性,催化脯氨酸残基的顺反异构化,参与蛋白质折叠、前体mRNA剪接等过程。PPIL1是剪接体B复合物的组分,在剪接催化中发挥重要作用。研究表明,PPIL1突变与多种疾病相关,包括神经发育障碍和癌症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | PPIL1突变导致剪接体功能异常,影响神经发育相关基因的表达,可能致病。 | ClinVar, OMIM |
| 癌症 | PPIL1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响剪接调控肿瘤发生发展。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能 |
| c.456C>T (p.Arg152Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使PPIL1活性丧失,影响剪接功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明PPIL1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):错义突变可能产生异常蛋白,干扰正常剪接体功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity) | • GO:0005681 (spliceosomal complex) |
| • GO:0006397 (mRNA processing) | • GO:0006457 (protein folding) |
相关通路
• hsa03040 (Spliceosome)
• hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)
蛋白质功能简介
PPIL1蛋白属于亲环蛋白家族,含有肽基脯氨酰异构酶结构域,催化脯氨酸残基的顺反异构化。作为剪接体B复合物的组分,PPIL1参与前体mRNA剪接的催化步骤,对基因表达调控至关重要。此外,PPIL1可能参与蛋白质折叠和应激反应。