PPM1K基因|基因功能、疾病关联、突变与代谢调控研究

PPM1K编码线粒体基质蛋白磷酸酶,通过去磷酸化BCKDH复合物调控支链氨基酸分解代谢,与代谢性疾病和神经系统疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PPM1K
基因全名 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1K
基因类型 protein coding
染色体位置 4q22.1
NCBI Gene ID 152926 ncbi.nlm.nih.gov/gene/152926
Ensembl ID ENSG00000163644
UniProt ID Q8TCD5
OMIM ID 617950
HGNC ID 24942
基因别名 PP2C-MP, PTMP, MP2C

基因功能与研究简介

PPM1K(protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1K)编码一种线粒体基质蛋白磷酸酶,属于PPM家族。该酶特异性去磷酸化支链α-酮酸脱氢酶复合物(BCKDH)的E1α亚基,从而激活BCKDH复合物,促进支链氨基酸(亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸)的分解代谢。PPM1K在氨基酸代谢、能量稳态和神经系统中发挥重要作用。研究表明,PPM1K表达异常与代谢性疾病(如2型糖尿病、肥胖)和神经系统疾病(如精神分裂症)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
支链酮酸尿症(枫糖尿症) PPM1K突变可能导致BCKDH复合物活性降低,支链氨基酸分解受阻,但该基因突变在MSUD中罕见,证据有限。 暂无明确证据
2型糖尿病 PPM1K表达水平与胰岛素敏感性相关,可能通过影响支链氨基酸代谢参与糖尿病发病。 具有较强研究证据
肥胖 PPM1K在脂肪组织中的表达与肥胖相关,可能通过调节能量代谢影响体重。 具有较强研究证据
精神分裂症 PPM1K基因变异与精神分裂症风险相关,可能通过影响神经递质代谢。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性或催化活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致PPM1K蛋白活性降低或缺失,从而减弱BCKDH复合物去磷酸化,支链氨基酸分解代谢受阻。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明PPM1K存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效突变:目前暂无明确证据表明PPM1K存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity) • GO:0005739 (mitochondrion)
• GO:0006006 (glucose metabolic process) • GO:0009083 (branched-chain amino acid catabolic process)

相关通路

hsa00280 (Valine
leucine and isoleucine degradation)
hsa04930 (Type II diabetes mellitus)

蛋白质功能简介

PPM1K蛋白由365个氨基酸组成,定位于线粒体基质。其N端含有线粒体靶向序列,成熟蛋白具有PP2C磷酸酶催化结构域。PPM1K通过去磷酸化BCKDH复合物的E1α亚基(Ser293),激活BCKDH复合物,从而促进支链氨基酸的氧化脱羧。此外,PPM1K还可能参与其他底物的去磷酸化,如丙酮酸脱氢酶复合物,但具体机制尚需进一步研究。

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