PPP6C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PPP6C编码蛋白磷酸酶6催化亚基,参与细胞周期调控和DNA损伤修复,其突变与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PPP6C
基因全名 protein phosphatase 6 catalytic subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q33.3
NCBI Gene ID 5537 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5537
Ensembl ID ENSG00000119414
UniProt ID O00743
OMIM ID 612725
HGNC ID 9324
基因别名 PP6C, PPP6

基因功能与研究简介

PPP6C基因编码蛋白磷酸酶6的催化亚基,属于丝氨酸/苏氨酸磷酸酶家族。该蛋白参与多种细胞过程,包括细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞凋亡和应激反应。PPP6C通过去磷酸化关键底物如Aurora A和DNA-PK,调节有丝分裂和基因组稳定性。研究表明,PPP6C在多种癌症中存在突变或表达异常,提示其在肿瘤发生中可能发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
黑色素瘤 PPP6C突变(如R264C、R264H)导致磷酸酶活性降低或底物特异性改变,影响细胞周期和DNA损伤修复,促进肿瘤发生。 已明确致病(COSMIC, ClinVar)
肺癌 PPP6C表达异常或突变可能参与肺癌的发生发展,但具体机制尚不完全清楚。 具有较强研究证据(COSMIC)
肝癌 PPP6C在肝癌中表达上调,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤进展。 潜在关联(研究报道)
乳腺癌 PPP6C突变或表达改变与乳腺癌的预后相关,但证据尚不充分。 潜在关联(研究报道)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
R264C 错义突变 黑色素瘤中约5% 可能影响底物识别,导致磷酸酶活性降低(Loss of Function)
R264H 错义突变 黑色素瘤中约2% 可能影响底物识别,导致磷酸酶活性降低(Loss of Function)
D167N 错义突变 肺癌中罕见 可能影响催化活性,导致功能缺失(Loss of Function)
E420K 错义突变 肝癌中罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用(功能未知)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):如R264C和R264H,导致PPP6C磷酸酶活性降低或丧失,影响细胞周期和DNA损伤修复,促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明PPP6C存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明PPP6C存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004721 (phosphoprotein phosphatase activity) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0007049 (cell cycle) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0006915 (apoptotic process)

相关通路

hsa04110 (Cell cycle)
hsa03430 (Mismatch repair)
hsa03420 (Nucleotide excision repair)
hsa03440 (Homologous recombination)

蛋白质功能简介

PPP6C蛋白是蛋白磷酸酶6的催化亚基,属于PPP家族。该蛋白与调节亚基结合形成全酶,通过去磷酸化多种底物参与细胞周期调控、DNA损伤修复和应激反应。PPP6C在细胞分裂中调节Aurora A的活性,确保有丝分裂正常进行;在DNA损伤时,参与ATM/ATR介导的检查点信号。此外,PPP6C还参与细胞凋亡和自噬的调控。其突变或表达异常与多种癌症相关,是潜在的药物靶点。

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