PRDM10基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRDM10是一种转录调控因子,参与细胞分化与肿瘤发生,其突变与软组织肉瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRDM10 |
|---|---|
| 基因全名 | PRDM family member 10 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q24.3 |
| NCBI Gene ID | 56980 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56980 |
| Ensembl ID | ENSG00000137713 |
| UniProt ID | Q9NQV6 |
| OMIM ID | 616761 |
| HGNC ID | 13987 |
| 基因别名 | PFM10, PR-domain containing protein 10 |
基因功能与研究简介
PRDM10(PRDI-BF1 and RIZ homology domain containing 10)是一种转录调控因子,属于PRDM家族。该蛋白包含一个N端的PR结构域和多个锌指基序,可能参与基因表达的调控。研究表明PRDM10在细胞分化、增殖和凋亡中发挥作用,其异常表达或突变与多种肿瘤相关,尤其是软组织肉瘤。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 软组织肉瘤 | PRDM10基因重排或突变可能导致蛋白功能异常,参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | PRDM10表达异常可能与结直肠癌的进展相关。 | 潜在关联 |
| 其他癌症 | PRDM10在多种癌症中表达异常,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A-673 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HT-1080 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SW982 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| PRDM10重排 | 基因重排 | 罕见 | 可能产生融合蛋白,导致功能获得或异常 |
| 错义突变 | 点突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构或功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致PRDM10蛋白失活,影响其转录调控功能,可能与肿瘤发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强PRDM10的活性,促进细胞增殖或抑制分化。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常PRDM10的功能,导致调控异常。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• 暂无明确通路
蛋白质功能简介
PRDM10蛋白包含一个PR结构域和多个C2H2型锌指基序,可能作为转录因子调控基因表达。PR结构域可能参与组蛋白甲基化修饰,从而影响染色质状态。PRDM10在细胞分化、增殖和凋亡中发挥作用,其异常表达与肿瘤发生相关。