PRDM10基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PRDM10是一种转录调控因子,参与细胞分化与肿瘤发生,其突变与软组织肉瘤相关。

基因信息卡

基因符号 PRDM10
基因全名 PRDM family member 10
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q24.3
NCBI Gene ID 56980 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56980
Ensembl ID ENSG00000137713
UniProt ID Q9NQV6
OMIM ID 616761
HGNC ID 13987
基因别名 PFM10, PR-domain containing protein 10

基因功能与研究简介

PRDM10(PRDI-BF1 and RIZ homology domain containing 10)是一种转录调控因子,属于PRDM家族。该蛋白包含一个N端的PR结构域和多个锌指基序,可能参与基因表达的调控。研究表明PRDM10在细胞分化、增殖和凋亡中发挥作用,其异常表达或突变与多种肿瘤相关,尤其是软组织肉瘤。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
软组织肉瘤 PRDM10基因重排或突变可能导致蛋白功能异常,参与肿瘤发生。 较强研究证据
结直肠癌 PRDM10表达异常可能与结直肠癌的进展相关。 潜在关联
其他癌症 PRDM10在多种癌症中表达异常,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
A-673 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HT-1080 暂无可靠数据 暂无可靠数据
SW982 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
PRDM10重排 基因重排 罕见 可能产生融合蛋白,导致功能获得或异常
错义突变 点突变 罕见 可能影响蛋白结构或功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致PRDM10蛋白失活,影响其转录调控功能,可能与肿瘤发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强PRDM10的活性,促进细胞增殖或抑制分化。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常PRDM10的功能,导致调控异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

相关通路

暂无明确通路

蛋白质功能简介

PRDM10蛋白包含一个PR结构域和多个C2H2型锌指基序,可能作为转录因子调控基因表达。PR结构域可能参与组蛋白甲基化修饰,从而影响染色质状态。PRDM10在细胞分化、增殖和凋亡中发挥作用,其异常表达与肿瘤发生相关。

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