PRDM6基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRDM6是一种表观遗传调控因子，在血管平滑肌细胞分化中发挥关键作用，其突变与先天性心脏病和肺动脉高压相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRDM6 |
|---|---|
| 基因全名 | PRDM family 6 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q23.2 |
| NCBI Gene ID | 93166 ncbi.nlm.nih.gov/gene/93166 |
| Ensembl ID | ENSG00000113721 |
| UniProt ID | Q9NQZ5 |
| OMIM ID | 616120 |
| HGNC ID | 9350 |
| 基因别名 | PR/SET domain 6, PRDM6, MDS1, MDS1-EVI1 |
基因功能与研究简介
PRDM6（PRDM family 6）编码一种含有PR/SET结构域的蛋白质，属于PRDM家族。该蛋白具有组蛋白甲基转移酶活性，能够催化组蛋白H3K9me2的甲基化，从而调控基因表达。PRDM6在血管平滑肌细胞（VSMC）中高表达，是VSMC分化的重要调控因子。它通过抑制平滑肌细胞增殖和促进分化，维持血管稳态。PRDM6的突变或表达异常与多种疾病相关，包括先天性心脏病、肺动脉高压和某些癌症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性心脏病 | PRDM6突变导致心脏发育异常，可能通过影响心脏神经嵴细胞的分化 | ClinVar, OMIM |
| 肺动脉高压 | PRDM6表达下调导致血管平滑肌细胞增殖，促进肺动脉重构 | 研究证据，PMID: 29217508 |
| 癌症 | PRDM6在多种肿瘤中表达异常，可能通过表观遗传调控影响肿瘤发生发展 | 研究证据，PMID: 25620004 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 血管 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 血管平滑肌细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 内皮细胞 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function，导致蛋白截短，功能丧失 |
| c.456_457del (p.Glu153fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function，导致蛋白截短，功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
PRDM6功能丧失突变导致其组蛋白甲基转移酶活性降低或缺失，影响下游基因表达，导致血管平滑肌细胞分化异常，与先天性心脏病和肺动脉高压相关。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据表明PRDM6存在功能获得性突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据表明PRDM6突变具有显性负效应。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0008270 zinc ion binding | • GO:0018024 histone-lysine N-methyltransferase activity |
| • GO:0042802 identical protein binding | • GO:0045892 negative regulation of transcription |
| • DNA-templated |
相关通路
• hsa04550: Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells
• hsa05200: Pathways in cancer
蛋白质功能简介
PRDM6蛋白含有PR/SET结构域，具有组蛋白甲基转移酶活性，催化组蛋白H3K9me2的甲基化。该蛋白主要在细胞核中表达，通过调控基因表达参与血管平滑肌细胞的分化。PRDM6能够抑制平滑肌细胞的增殖，促进其分化，从而维持血管稳态。此外，PRDM6还参与心脏发育和肺血管重构等过程。
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