PRICKLE1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRICKLE1基因编码Prickle平面细胞极性蛋白1,参与Wnt信号通路和神经发育,其突变与癫痫、共济失调等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRICKLE1 |
|---|---|
| 基因全名 | prickle planar cell polarity protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q12 |
| NCBI Gene ID | 144165 ncbi.nlm.nih.gov/gene/144165 |
| Ensembl ID | ENSG00000139187 |
| UniProt ID | Q96MT3 |
| OMIM ID | 608500 |
| HGNC ID | 20419 |
| 基因别名 | RILP, FLJ20196, MGC126562, MGC126564 |
基因功能与研究简介
PRICKLE1基因编码Prickle平面细胞极性蛋白1,属于LIM结构域蛋白家族。该蛋白在Wnt信号通路中发挥作用,参与平面细胞极性(PCP)的建立,对神经管闭合、神经元迁移和轴突导向等发育过程至关重要。PRICKLE1突变与多种神经系统疾病相关,包括进行性肌阵挛癫痫-共济失调综合征(PMEAS)和癫痫。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 进行性肌阵挛癫痫-共济失调综合征(PMEAS) | PRICKLE1基因突变导致蛋白功能异常,影响Wnt/PCP信号通路,干扰神经发育,导致疾病。 | 已明确致病 |
| 癫痫 | PRICKLE1突变可能增加癫痫易感性,具体机制尚在研究中。 | 具有较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | PRICKLE1在神经发育中起关键作用,突变可能导致智力障碍等。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.739C>T (p.Arg247Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1250G>A (p.Arg417His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1045C>T (p.Arg349Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或显著降低,如无义突变导致的截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):突变导致蛋白获得新的或增强的功能,目前PRICKLE1未见明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性效应):突变蛋白干扰正常蛋白的功能,目前PRICKLE1未见明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005886 plasma membrane | • GO:0007165 signal transduction |
| • GO:0030036 actin cytoskeleton organization | • GO:0007411 axon guidance |
相关通路
• Wnt signaling pathway (P00057)
• Planar cell polarity pathway (P00052)
蛋白质功能简介
PRICKLE1蛋白包含三个LIM结构域和一个PET结构域,定位于细胞质和细胞膜。它作为Wnt/PCP信号通路的调节因子,参与细胞极性的建立和细胞骨架的重塑。在神经系统中,PRICKLE1对神经元迁移和轴突导向至关重要。