PRKCSH基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRKCSH基因编码蛋白激酶C底物蛋白,参与糖蛋白折叠和质量控制,其突变与常染色体显性多囊肝病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRKCSH |
|---|---|
| 基因全名 | protein kinase C substrate 80K-H |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 19p13.2 |
| NCBI Gene ID | 5589 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5589 |
| Ensembl ID | ENSG00000105662 |
| UniProt ID | P14314 |
| OMIM ID | 177060 |
| HGNC ID | 9411 |
| 基因别名 | 80K-H, CLSD, PCLD, PKCSH |
基因功能与研究简介
PRKCSH基因编码蛋白激酶C底物蛋白(80K-H),该蛋白是葡萄糖苷酶II的β亚基,参与N-连接糖蛋白的折叠和质量控制。PRKCSH基因突变与常染色体显性多囊肝病(PCLD)相关,该病以肝脏多发囊肿为特征,通常不累及肾脏。PRKCSH蛋白在多种组织中表达,尤其在肝脏中高表达。研究表明,PRKCSH基因突变导致蛋白功能丧失,影响糖蛋白加工,进而导致肝囊肿形成。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 多囊肝病(Polycystic liver disease, PCLD) | PRKCSH基因突变导致蛋白功能丧失,影响糖蛋白加工,导致肝囊肿形成。 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma) | PRKCSH表达异常可能与肝细胞癌的发生发展相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.292C>T (p.Arg98Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1120delA (p.Thr374ProfsTer26) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1240C>T (p.Arg414Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致PRKCSH蛋白功能缺失或显著降低,影响糖蛋白加工,与多囊肝病相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PRKCSH存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PRKCSH存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004573 (mannosyl-oligosaccharide glucosidase activity) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0006457 (protein folding) | • GO:0018279 (protein N-linked glycosylation via asparagine) |
相关通路
• N-Glycan biosynthesis (hsa00510)
• Protein processing in endoplasmic reticulum (hsa04141)
蛋白质功能简介
PRKCSH蛋白(80K-H)是葡萄糖苷酶II的β亚基,该酶催化N-连接寡糖的修剪,参与糖蛋白的折叠和质量控制。PRKCSH蛋白定位于内质网,与α亚基形成复合物。PRKCSH基因突变导致蛋白功能丧失,影响糖蛋白加工,进而导致肝囊肿形成。