PRMT6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRMT6是一种精氨酸甲基转移酶,通过组蛋白修饰调控基因表达,参与DNA损伤修复、细胞周期调控及癌症发生发展。
基因信息卡
| 基因符号 | PRMT6 |
|---|---|
| 基因全名 | protein arginine methyltransferase 6 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 1p13.3 |
| NCBI Gene ID | 55170 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55170 |
| Ensembl ID | ENSG00000198890 |
| UniProt ID | Q96LA8 |
| OMIM ID | 608274 |
| HGNC ID | 30405 |
| 基因别名 | HRMT1L6 |
基因功能与研究简介
PRMT6(protein arginine methyltransferase 6)是一种I型精氨酸甲基转移酶,催化组蛋白H3R2、H4R3等位点的非对称二甲基化修饰,从而调控基因转录、DNA损伤修复、细胞周期和病毒复制等过程。PRMT6在多种肿瘤中高表达,与肿瘤发生发展密切相关,是潜在的抗癌药物靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 膀胱癌 | PRMT6在膀胱癌中高表达,通过甲基化组蛋白H3R2抑制抑癌基因表达,促进肿瘤增殖和侵袭。 | 较强研究证据 |
| 前列腺癌 | PRMT6在前列腺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控雄激素受体信号通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | PRMT6在非小细胞肺癌中高表达,促进细胞增殖和迁移,与患者生存率降低相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | PRMT6在乳腺癌中表达异常,可能通过影响雌激素受体信号通路参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 胶质母细胞瘤 | PRMT6在胶质母细胞瘤中高表达,促进肿瘤干细胞干性和放疗抵抗。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| LNCaP | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
| U87MG | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.113G>A (p.Arg38His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
| c.487C>T (p.Arg163Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响底物识别 |
| c.742A>G (p.Thr248Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致PRMT6酶活性降低或丧失,可能影响组蛋白甲基化修饰,进而改变基因表达。
Gain of Function(功能获得,GOF)
增强PRMT6酶活性或底物特异性,可能导致异常甲基化,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
突变体干扰野生型PRMT6功能,可能通过竞争底物或形成无活性二聚体实现。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0008168 (methyltransferase activity) |
| • GO:0016274 (protein-arginine N-methyltransferase activity) | • GO:0006325 (chromatin organization) |
| • GO:0006355 (regulation of transcription | • DNA-templated) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) |
相关通路
• Arginine methylation (R-HSA-3214842)
• Chromatin modifying enzymes (R-HSA-3244109)
• DNA damage response (R-HSA-73894)
蛋白质功能简介
PRMT6蛋白由375个氨基酸组成,包含SAM依赖的甲基转移酶结构域。它主要定位于细胞核,催化组蛋白H3R2和H4R3的非对称二甲基化,抑制基因转录。PRMT6还参与DNA损伤修复,通过甲基化非组蛋白底物如DNA聚合酶β等调控修复过程。其表达受细胞周期和应激信号调控。