PRODH基因|脯氨酸脱氢酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRODH基因编码脯氨酸脱氢酶,是脯氨酸代谢的关键酶,其突变与高脯氨酸血症、精神分裂症等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRODH |
|---|---|
| 基因全名 | proline dehydrogenase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q11.21 |
| NCBI Gene ID | 5625 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5625 |
| Ensembl ID | ENSG00000100109 |
| UniProt ID | O43272 |
| OMIM ID | 606810 |
| HGNC ID | 9453 |
| 基因别名 | PRODH1, PRODH2, HSPOX2, PIG6, POX |
基因功能与研究简介
PRODH基因编码脯氨酸脱氢酶(proline dehydrogenase),该酶位于线粒体内膜,催化脯氨酸转化为Δ1-吡咯啉-5-羧酸(P5C),是脯氨酸分解代谢的第一步。PRODH在多种组织中表达,尤其在脑、肝和肾中高表达。该基因位于22q11.2区域,该区域缺失与DiGeorge综合征相关。PRODH的突变可导致脯氨酸代谢异常,与高脯氨酸血症、精神分裂症等疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 高脯氨酸血症I型 | PRODH基因突变导致脯氨酸脱氢酶活性降低或缺失,引起脯氨酸在血液和尿液中积累。 | 已明确致病 |
| 精神分裂症 | PRODH基因变异可能影响脯氨酸代谢,进而影响神经递质功能,增加精神分裂症风险。 | 具有较强研究证据 |
| 双相情感障碍 | PRODH基因多态性与双相情感障碍的易感性相关。 | 潜在关联 |
| 自闭症谱系障碍 | PRODH基因变异可能通过影响脯氨酸代谢参与自闭症的发病机制。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.425C>T (p.Pro142Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能降低酶活性 |
| c.1352G>A (p.Arg451Gln) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.853G>A (p.Gly285Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能降低酶活性 |
| c.1159C>T (p.Arg387Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PRODH基因的失功能突变(如无义突变、移码突变)导致脯氨酸脱氢酶活性降低或缺失,引起脯氨酸代谢障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PRODH存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PRODH突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • 脯氨酸脱氢酶活性 (GO:0004657) | • 线粒体内膜 (GO:0005743) |
| • 脯氨酸分解代谢过程 (GO:0006562) | • 氧化还原酶活性 (GO:0016491) |
相关通路
• 脯氨酸代谢 (hsa00330)
• 氨基酸代谢 (hsa01230)
蛋白质功能简介
PRODH编码的脯氨酸脱氢酶(EC 1.5.5.2)是脯氨酸分解代谢的关键酶,催化脯氨酸氧化为P5C,并传递电子到呼吸链。该酶以同源二聚体形式存在于线粒体内膜,其活性受底物诱导和产物抑制。PRODH在脑、肝、肾中高表达,参与能量代谢、氧化应激和神经递质调节。PRODH基因位于22q11.2区域,该区域拷贝数变异与多种神经精神疾病相关。
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