PROM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PROM1(Prominin 1)编码一种跨膜糖蛋白,是造血干细胞和多种组织干细胞的标志物,参与细胞膜突起形成和信号调控,其突变与视网膜变性及多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PROM1
基因全名 prominin 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 4p15.32
NCBI Gene ID 8842 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8842
Ensembl ID ENSG00000007062
UniProt ID O43490
OMIM ID 604365
HGNC ID 9454
基因别名 AC133, CD133, PROML1, RP41, STGD4

基因功能与研究简介

PROM1基因编码Prominin-1蛋白,是一种五次跨膜糖蛋白,最初被鉴定为造血干细胞标志物CD133。该蛋白定位于细胞膜突起,如微绒毛和初级纤毛,参与细胞形态发生、信号转导和细胞极性。PROM1在多种组织干细胞和肿瘤干细胞中表达,与肿瘤发生、耐药和转移相关。此外,PROM1突变可导致视网膜变性,如视网膜色素变性(RP)和Stargardt病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 PROM1突变导致蛋白功能异常,影响光感受器细胞外节盘膜形态,导致感光细胞凋亡。 已明确致病(OMIM)
Stargardt病 PROM1突变与常染色体隐性Stargardt病相关,机制类似视网膜色素变性。 已明确致病(OMIM)
多种癌症 PROM1高表达于肿瘤干细胞,与肿瘤增殖、转移和耐药相关,但具体机制尚在研究中。 具有较强研究证据(COSMIC)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
视网膜 暂无可靠数据 暂无可靠数据
造血组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1870C>T (p.Arg624Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1117C>T (p.Arg373Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠或定位,功能影响待验证
c.2015G>A (p.Arg672His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,具体机制待研究
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失,与视网膜变性相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能干扰正常蛋白功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0007165 (signal transduction)
• GO:0007601 (visual perception)

相关通路

Notch signaling pathway (WP268)
Wnt signaling pathway (WP363)

蛋白质功能简介

Prominin-1(CD133)是一种五次跨膜糖蛋白,分子量约120 kDa,高度糖基化。它定位于细胞膜突起,参与膜微域的形成和信号复合物的组装。在正常组织中,PROM1表达于多种干细胞和祖细胞,如造血干细胞、神经干细胞和视网膜前体细胞。在肿瘤中,PROM1作为肿瘤干细胞标志物,与肿瘤起始、耐药和转移相关。PROM1的胞外域可被剪切,产生可溶性形式,可能作为生物标志物。

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