PRPF19基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PRPF19是pre-mRNA剪接和DNA损伤修复的关键因子,其突变与多种癌症和神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 PRPF19
基因全名 pre-mRNA processing factor 19
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q12.2
NCBI Gene ID 27339 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27339
Ensembl ID ENSG00000110107
UniProt ID Q9UMS4
OMIM ID 608330
HGNC ID 17896
基因别名 PRP19, SNEV, hPSO4, NMP200

基因功能与研究简介

PRPF19基因编码pre-mRNA剪接因子和E3泛素连接酶,是剪接体复合物的核心组分,参与前体mRNA剪接、DNA损伤修复、细胞周期调控和凋亡等过程。PRPF19通过其U-box结构域发挥E3泛素连接酶活性,调控多种底物的泛素化。该基因的突变与多种癌症和神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 PRPF19在多种癌症中表达异常,可能通过影响剪接和DNA修复促进肿瘤发生发展。 较强研究证据
神经发育障碍 PRPF19突变与智力障碍和发育迟缓相关,可能通过影响神经发育相关基因的剪接。 较强研究证据
共济失调 PRPF19突变与常染色体隐性遗传性共济失调相关,可能通过影响小脑神经元功能。 较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1102C>T (p.Arg368Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响剪接功能
c.1255A>G (p.Thr419Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或功能
c.1576C>T (p.Arg526Trp) 错义突变 罕见 可能影响U-box结构域功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或降低,如无义突变导致的截短蛋白。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明PRPF19存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):突变蛋白可能干扰正常蛋白功能,但具体证据尚不充分。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 (mRNA splicing • via spliceosome)
• GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005681 (spliceosomal complex)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa03420 (Nucleotide excision repair)

蛋白质功能简介

PRPF19蛋白是剪接体复合物的核心组分,参与pre-mRNA剪接。同时,它作为E3泛素连接酶,在DNA损伤修复中发挥作用。PRPF19通过其U-box结构域介导底物泛素化,调控细胞周期和凋亡。该蛋白在多种组织中表达,其功能异常与癌症和神经发育障碍相关。

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