PRPF19基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRPF19是pre-mRNA剪接和DNA损伤修复的关键因子,其突变与多种癌症和神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRPF19 |
|---|---|
| 基因全名 | pre-mRNA processing factor 19 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q12.2 |
| NCBI Gene ID | 27339 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27339 |
| Ensembl ID | ENSG00000110107 |
| UniProt ID | Q9UMS4 |
| OMIM ID | 608330 |
| HGNC ID | 17896 |
| 基因别名 | PRP19, SNEV, hPSO4, NMP200 |
基因功能与研究简介
PRPF19基因编码pre-mRNA剪接因子和E3泛素连接酶,是剪接体复合物的核心组分,参与前体mRNA剪接、DNA损伤修复、细胞周期调控和凋亡等过程。PRPF19通过其U-box结构域发挥E3泛素连接酶活性,调控多种底物的泛素化。该基因的突变与多种癌症和神经发育障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | PRPF19在多种癌症中表达异常,可能通过影响剪接和DNA修复促进肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | PRPF19突变与智力障碍和发育迟缓相关,可能通过影响神经发育相关基因的剪接。 | 较强研究证据 |
| 共济失调 | PRPF19突变与常染色体隐性遗传性共济失调相关,可能通过影响小脑神经元功能。 | 较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1102C>T (p.Arg368Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响剪接功能 |
| c.1255A>G (p.Thr419Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能 |
| c.1576C>T (p.Arg526Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响U-box结构域功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或降低,如无义突变导致的截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明PRPF19存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):突变蛋白可能干扰正常蛋白功能,但具体证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000398 (mRNA splicing | • via spliceosome) |
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005681 (spliceosomal complex) |
相关通路
• hsa03040 (Spliceosome)
• hsa03420 (Nucleotide excision repair)
蛋白质功能简介
PRPF19蛋白是剪接体复合物的核心组分,参与pre-mRNA剪接。同时,它作为E3泛素连接酶,在DNA损伤修复中发挥作用。PRPF19通过其U-box结构域介导底物泛素化,调控细胞周期和凋亡。该蛋白在多种组织中表达,其功能异常与癌症和神经发育障碍相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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