PRPF38A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PRPF38A是剪接体组装的关键调控因子,其突变与多种疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PRPF38A
基因全名 pre-mRNA processing factor 38A
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p32.3
NCBI Gene ID 84950 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84950
Ensembl ID ENSG00000116830
UniProt ID Q8NAV1
OMIM ID 612147
HGNC ID 26006
基因别名 PRP38, PRPF38, Prp38p

基因功能与研究简介

PRPF38A基因编码pre-mRNA processing factor 38A,是剪接体U4/U6.U5 tri-snRNP复合物的组成部分,参与前体mRNA剪接的催化步骤。该蛋白在剪接体组装和剪接激活中发挥关键作用,其功能异常可能导致RNA剪接失调,进而影响细胞稳态。研究表明PRPF38A在多种组织中广泛表达,尤其在睾丸和脑中高表达。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 PRPF38A突变可能影响剪接体功能,导致视网膜细胞凋亡,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 PRPF38A在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控剪接影响肿瘤发生发展,但具体关联需进一步研究。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或功能
c.567_568del (p.Glu189fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响剪接体功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 (spliceosomal complex) • GO:0000398 (mRNA splicing
• via spliceosome) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

PRPF38A蛋白是剪接体U4/U6.U5 tri-snRNP复合物的组分,参与剪接体的组装和催化。该蛋白含有PRP38 domain,可能参与RNA结合或蛋白-蛋白相互作用。其表达水平在细胞周期中受到调控,提示其在细胞增殖中具有作用。

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