PRPS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PRPS1基因编码磷酸核糖焦磷酸合成酶1,是嘌呤和嘧啶核苷酸从头合成途径的关键酶,其突变可导致多种神经发育障碍和遗传性疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | PRPS1 |
|---|---|
| 基因全名 | phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xq22.3 |
| NCBI Gene ID | 5631 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5631 |
| Ensembl ID | ENSG00000147224 |
| UniProt ID | P60891 |
| OMIM ID | 311850 |
| HGNC ID | 9462 |
| 基因别名 | PRS-I, CMTX5, DFN2, PRPS1A |
基因功能与研究简介
PRPS1基因编码磷酸核糖焦磷酸合成酶1(PRS-I),该酶催化5-磷酸核糖与ATP反应生成5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP),是嘌呤和嘧啶核苷酸从头合成途径的关键步骤。PRPS1在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。PRPS1基因突变可导致多种疾病,包括X连锁神经病变、Arts综合征和PRPS1超活性等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| X连锁神经病变(CMTX5) | PRPS1基因突变导致PRS-I酶活性降低,影响核苷酸合成,进而导致周围神经病变和听力损失。 | 已明确致病 |
| Arts综合征 | PRPS1基因突变导致PRS-I酶活性降低,影响核苷酸合成,导致智力障碍、听力损失和视神经萎缩。 | 已明确致病 |
| PRPS1超活性 | PRPS1基因突变导致PRS-I酶活性增强,导致尿酸生成过多,引起痛风。 | 已明确致病 |
| 非综合征性听力损失(DFN2) | PRPS1基因突变导致PRS-I酶活性降低,影响内耳毛细胞功能,导致听力损失。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 广泛表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 表达 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.455A>G (p.Asn152Ser) | 错义突变 | 罕见 | 降低酶活性 |
| c.559G>A (p.Gly187Arg) | 错义突变 | 罕见 | 降低酶活性 |
| c.640C>T (p.Arg214Cys) | 错义突变 | 罕见 | 降低酶活性 |
| c.1132C>T (p.Arg378Cys) | 错义突变 | 罕见 | 降低酶活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数PRPS1致病突变导致酶活性降低,属于功能缺失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
PRPS1超活性相关突变导致酶活性增强,属于功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PRPS1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000287 (magnesium ion binding) | • GO:0004749 (ribose phosphate diphosphokinase activity) |
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0009156 (ribonucleoside monophosphate biosynthetic process) |
| • GO:0006164 (purine nucleotide biosynthetic process) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• 嘌呤代谢 (Purine metabolism)
• 嘧啶代谢 (Pyrimidine metabolism)
• 核苷酸从头合成 (De novo nucleotide biosynthesis)
蛋白质功能简介
PRPS1编码的PRS-I蛋白是磷酸核糖焦磷酸合成酶的同工酶之一,以同源六聚体形式存在。该酶催化PRPP的生成,PRPP是嘌呤和嘧啶核苷酸合成的重要前体。PRS-I活性受ADP和GDP的反馈抑制。PRPS1突变导致酶活性改变,影响核苷酸合成,进而导致多种疾病。
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