PRR13基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
PRR13(Proline Rich 13)是一种富含脯氨酸的蛋白,参与细胞凋亡调控和化疗耐药,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PRR13 |
|---|---|
| 基因全名 | proline rich 13 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 12q13.13 |
| NCBI Gene ID | 54458 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54458 |
| Ensembl ID | ENSG00000135446 |
| UniProt ID | Q9NZN9 |
| OMIM ID | 616707 |
| HGNC ID | 24018 |
| 基因别名 | HCBP6, HCB6, FLJ10986 |
基因功能与研究简介
PRR13(Proline Rich 13)基因编码一种富含脯氨酸的蛋白质,最初被鉴定为与HCV核心蛋白结合的蛋白。PRR13在多种组织中表达,参与细胞凋亡的调控,并可能通过抑制TGF-β信号通路影响肿瘤发生。研究表明,PRR13在多种癌症中表达上调,与化疗耐药和不良预后相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非小细胞肺癌 | PRR13高表达与化疗耐药相关,可能通过抑制凋亡促进肿瘤生存。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | PRR13表达上调,与肿瘤进展和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | PRR13可能通过影响TGF-β信号通路参与肝癌发生。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | PRR13表达与化疗反应相关,可能作为耐药标志物。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Pro41Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但证据不足 |
| c.456G>A (p.Thr152Thr) | 同义突变 | 暂无可靠数据 | 无功能影响 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (KEGG: hsa04350)
蛋白质功能简介
PRR13蛋白由109个氨基酸组成,富含脯氨酸,定位于细胞质。它可能通过与其他蛋白相互作用参与凋亡调控,并影响TGF-β信号通路。在多种癌细胞中高表达,与化疗耐药相关。