PSAP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PSAP基因编码鞘脂激活蛋白原,是溶酶体鞘脂代谢的关键调控因子,其突变可导致多种神经退行性疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | PSAP |
|---|---|
| 基因全名 | prosaposin |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q22.1 |
| NCBI Gene ID | 5660 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5660 |
| Ensembl ID | ENSG00000197746 |
| UniProt ID | P07602 |
| OMIM ID | 176801 |
| HGNC ID | 9498 |
| 基因别名 | SAP1; GLOP; SAP-1; proactivator polypeptide |
基因功能与研究简介
PSAP基因编码鞘脂激活蛋白原(prosaposin),该蛋白经蛋白水解后产生四种鞘脂激活蛋白(saposins A, B, C, D),它们在溶酶体中作为鞘脂水解酶的辅助因子,参与鞘脂的降解过程。PSAP基因突变可导致多种溶酶体贮积症,如Gaucher病、异染性脑白质营养不良等。此外,PSAP还参与细胞信号转导、细胞凋亡和神经保护等过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Gaucher病 | PSAP突变导致saposin C缺乏,影响β-葡萄糖脑苷脂酶活性,导致葡萄糖脑苷脂在巨噬细胞中蓄积,引起肝脾肿大、贫血和骨病变。 | 已明确致病 |
| 异染性脑白质营养不良 | PSAP突变导致saposin B缺乏,影响芳基硫酸酯酶A活性,导致硫苷脂在少突胶质细胞中蓄积,引起中枢和周围神经系统脱髓鞘。 | 已明确致病 |
| Krabbe病 | PSAP突变导致saposin A缺乏,影响半乳糖脑苷脂酶活性,导致半乳糖脑苷脂蓄积,引起神经系统退行性变。 | 已明确致病 |
| PSAP相关神经退行性疾病 | PSAP突变导致saposin D缺乏,可能影响鞘磷脂酶活性,导致鞘磷脂蓄积,与神经退行性变相关。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.802A>G (p.Met268Val) | 错义突变 | 罕见 | 影响saposin C功能,导致Gaucher病 |
| c.577C>T (p.Arg193Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致saposin B缺乏,引起异染性脑白质营养不良 |
| c.1048C>T (p.Arg350Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致saposin A缺乏,引起Krabbe病 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | 影响蛋白翻译,导致PSAP功能缺失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数PSAP突变导致功能缺失,如无义突变、移码突变等,导致saposin蛋白缺乏或功能异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PSAP存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PSAP突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005764 (lysosome) | • GO:0007190 (activation of phospholipase C activity) |
| • GO:0008283 (cell population proliferation) | • GO:0005540 (hyaluronic acid binding) |
| • GO:0008201 (heparin binding) | • GO:0005102 (signaling receptor binding) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005615 (extracellular space) |
| • GO:0005794 (Golgi apparatus) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Sphingolipid metabolism (KEGG: hsa00600)
• Lysosome (KEGG: hsa04142)
• Sphingolipid signaling pathway (KEGG: hsa04071)
蛋白质功能简介
PSAP基因编码的prosaposin蛋白是一种前体蛋白,经蛋白水解后产生四种saposin蛋白(A、B、C、D)。这些saposin蛋白是溶酶体鞘脂水解酶所必需的辅助因子,参与鞘脂的降解。PSAP蛋白还以全长形式分泌到细胞外,具有神经保护、细胞信号转导等非溶酶体功能。PSAP突变导致saposin蛋白缺乏或功能异常,进而引发多种溶酶体贮积症。
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