PSMC3IP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PSMC3IP是DNA双链断裂修复和同源重组的关键调控因子,其突变与卵巢发育异常及肿瘤易感性相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PSMC3IP |
|---|---|
| 基因全名 | PSMC3IP interacting protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q21.2 |
| NCBI Gene ID | 29893 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29893 |
| Ensembl ID | ENSG00000108771 |
| UniProt ID | Q9Y4A5 |
| OMIM ID | 608665 |
| HGNC ID | 17948 |
| 基因别名 | GT198, HOP2, TBPIP |
基因功能与研究简介
PSMC3IP(PSMC3 interacting protein)基因编码一种核蛋白,参与DNA双链断裂的同源重组修复。该蛋白与PSMC3(26S蛋白酶体ATP酶亚基)及RAD51等相互作用,促进同源重组修复。PSMC3IP在减数分裂中至关重要,其功能缺失可导致减数分裂停滞和卵巢发育异常。此外,PSMC3IP的异常表达与多种癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 卵巢发育不良 | PSMC3IP突变导致同源重组修复缺陷,影响减数分裂,导致卵巢发育不全和早发性卵巢功能不全。 | 已明确致病(OMIM) |
| 乳腺癌 | PSMC3IP在乳腺癌中高表达,可能通过促进同源重组修复导致肿瘤耐药。 | 具有较强研究证据(COSMIC) |
| 前列腺癌 | PSMC3IP在前列腺癌中表达上调,与肿瘤进展相关。 | 具有较强研究证据(COSMIC) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达(GTEx) |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 高表达(GTEx) |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达(GTEx) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.589C>T (p.Arg197Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.682G>A (p.Glu228Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致截短蛋白,丧失功能,影响同源重组修复。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006310 - homologous recombination | • GO:0005634 - nucleus |
| • GO:0003697 - single-stranded DNA binding | • GO:0005515 - protein binding |
相关通路
• Homologous recombination (Reactome: R-HSA-5693538)
• DNA double-str break repair (KEGG: hsa03440)
蛋白质功能简介
PSMC3IP蛋白由217个氨基酸组成,包含一个DNA结合结构域和一个与PSMC3相互作用的区域。该蛋白在细胞核中与RAD51等重组酶协同,促进同源重组修复。在减数分裂中,PSMC3IP对于同源染色体配对和交叉形成至关重要。