PTF1A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PTF1A是胰腺发育和神经分化的关键转录因子,其突变可导致胰腺发育不全和神经功能障碍。

基因信息卡

基因符号 PTF1A
基因全名 pancreas associated transcription factor 1a
基因类型 protein-coding
染色体位置 10p12.3
NCBI Gene ID 256297 ncbi.nlm.nih.gov/gene/256297
Ensembl ID ENSG00000168234
UniProt ID Q7RTS3
OMIM ID 607934
HGNC ID 23734
基因别名 PTF1-p48, bHLHa29, p48

基因功能与研究简介

PTF1A(胰腺相关转录因子1a)是碱性螺旋-环-螺旋转录因子家族成员,在胰腺发育和神经分化中发挥关键作用。PTF1A与RBPJ和E12/E47形成复合物,调控胰腺外分泌细胞和神经元的基因表达。PTF1A突变可导致胰腺发育不全和先天性神经病变。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
胰腺发育不全 PTF1A纯合突变导致胰腺发育不全,表现为新生儿糖尿病和胰腺外分泌功能不全。 已明确致病
先天性神经病变 PTF1A突变可导致小脑和脑干发育异常,引起共济失调和智力障碍。 已明确致病
胰腺癌 PTF1A在胰腺癌中表达异常,可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胰腺 暂无可靠数据 高表达
小脑 暂无可靠数据 中等表达
脑干 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
PANC-1 暂无可靠数据 胰腺癌细胞系
MIA PaCa-2 暂无可靠数据 胰腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.413A>G (p.Asn138Ser) 错义突变 罕见 可能影响DNA结合能力,导致功能丧失
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 导致蛋白质翻译起始受阻,功能丧失
c.679C>T (p.Arg227Ter) 无义突变 罕见 产生截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PTF1A突变导致功能丧失,是胰腺发育不全和神经病变的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PTF1A存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PTF1A突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) • GO:0007389 (pattern specification process)
• GO:0009887 (animal organ morphogenesis)

相关通路

Pancreas development pathway (KEGG: hsa04950)
Notch signaling pathway (KEGG: hsa04330)

蛋白质功能简介

PTF1A蛋白由263个氨基酸组成,包含一个碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域,负责与DNA结合和二聚化。PTF1A与RBPJ和E12/E47形成三聚体复合物,识别增强子盒(E-box)序列,激活靶基因转录。在胰腺发育中,PTF1A调控外分泌细胞分化;在神经系统中,PTF1A参与小脑和脑干神经元的生成。

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