PTPRN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PTPRN编码受体型酪氨酸磷酸酶样蛋白,是胰岛β细胞自身抗原,与1型糖尿病密切相关,并参与胰岛素分泌调控。
基因信息卡
| 基因符号 | PTPRN |
|---|---|
| 基因全名 | protein tyrosine phosphatase receptor type N |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 2q35 |
| NCBI Gene ID | 5798 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5798 |
| Ensembl ID | ENSG00000154328 |
| UniProt ID | Q16849 |
| OMIM ID | 601773 |
| HGNC ID | 9671 |
| 基因别名 | IA-2; IA2; PTP35 |
基因功能与研究简介
PTPRN(protein tyrosine phosphatase receptor type N)基因编码一种受体型酪氨酸磷酸酶样蛋白,属于蛋白酪氨酸磷酸酶家族。该蛋白主要表达于胰岛β细胞和神经内分泌细胞,位于分泌颗粒膜上,参与胰岛素分泌的调控。PTPRN是1型糖尿病的主要自身抗原之一,其自身抗体是1型糖尿病的生物标志物。此外,PTPRN可能参与神经内分泌细胞的信号转导和囊泡运输。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 1型糖尿病 | PTPRN是胰岛β细胞自身抗原,自身抗体介导的免疫反应导致β细胞破坏,胰岛素分泌不足。 | 已明确致病 |
| 胰岛素瘤 | PTPRN在胰岛素瘤中高表达,可能作为肿瘤标志物。 | 具有较强研究证据 |
| 其他自身免疫性疾病 | PTPRN自身抗体可能与其他自身免疫病相关,如自身免疫性甲状腺疾病。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| INS-1 | 暂无可靠数据 | 大鼠胰岛素瘤细胞系 |
| MIN6 | 暂无可靠数据 | 小鼠胰岛素瘤细胞系 |
| βTC-6 | 暂无可靠数据 | 小鼠胰岛素瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs1053195 | SNP | 未知 | 可能影响蛋白表达或功能,但证据不足 |
| c.2483C>T (p.Pro828Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,但功能影响未明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PTPRN功能缺失可能导致胰岛素分泌异常,但具体突变证据有限。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004725 (protein tyrosine phosphatase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0030141 (secretory granule) |
| • GO:0006887 (exocytosis) | • GO:0030073 (insulin secretion) |
相关通路
• Insulin secretion (WP481)
• Type I diabetes mellitus (KEGG hsa04940)
蛋白质功能简介
PTPRN蛋白是一种跨膜受体型酪氨酸磷酸酶样蛋白,但其磷酸酶活性可能缺失。该蛋白主要位于致密核心分泌颗粒膜上,在胰岛β细胞中高表达,参与胰岛素颗粒的成熟和胞吐过程。PTPRN的胞内区域含有磷酸酶样结构域,但缺乏催化活性,可能作为衔接蛋白参与信号转导。此外,PTPRN是1型糖尿病的关键自身抗原,其自身抗体可用于疾病预测和诊断。
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