PUF60基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PUF60是剪接体U2 snRNP复合物的核心组分,参与RNA剪接调控,其突变与Verheij综合征及多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PUF60
基因全名 poly(U) binding splicing factor 60
基因类型 protein-coding
染色体位置 8q24.3
NCBI Gene ID 22827 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22827
Ensembl ID ENSG00000179950
UniProt ID Q9UHX1
OMIM ID 604819
HGNC ID 17042
基因别名 FUSEBP1, RoBP1, SIAHBP1

基因功能与研究简介

PUF60基因编码poly(U)结合剪接因子60,是剪接体U2 snRNP复合物的核心组分,参与RNA剪接的调控。该蛋白具有RNA识别基序,能够结合poly(U)序列,在剪接体组装和剪接位点选择中发挥重要作用。PUF60还参与DNA损伤应答和转录调控。PUF60基因突变与Verheij综合征(一种罕见的发育障碍)相关,并在多种癌症中异常表达。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Verheij综合征 PUF60单倍剂量不足导致,表现为生长迟缓、智力障碍、面部畸形等 已明确致病
结直肠癌 PUF60表达上调,可能通过调控剪接促进肿瘤发生 具有较强研究证据
肺癌 PUF60表达异常,与预后相关 具有较强研究证据
乳腺癌 PUF60参与剪接调控,影响肿瘤相关基因表达 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1180C>T (p.Arg394Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1465A>G (p.Lys489Glu) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合,功能待验证
c.1021_1022del (p.Leu341fs) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PUF60功能缺失突变,如无义突变和移码突变,导致蛋白截短或降解,影响剪接功能,与Verheij综合征相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• RNA binding (GO:0003723) • mRNA splicing
• via spliceosome (GO:0000398) • U2 snRNP (GO:0005686)
• nucleus (GO:0005634)

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

PUF60蛋白由559个氨基酸组成,包含一个RNA识别基序(RRM)和一个U2 snRNP相互作用区域。作为剪接体U2 snRNP复合物的组分,PUF60参与前体mRNA剪接的早期步骤,协助U2 snRNA与分支点序列的配对。此外,PUF60还参与DNA损伤应答,与FUSE结合蛋白相互作用,调控基因表达。

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