PYCR1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PYCR1编码吡咯啉-5-羧酸还原酶1,参与脯氨酸合成,其突变与皮肤松弛症等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PYCR1 |
|---|---|
| 基因全名 | pyrroline-5-carboxylate reductase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q25.3 |
| NCBI Gene ID | 5831 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5831 |
| Ensembl ID | ENSG00000183091 |
| UniProt ID | P32322 |
| OMIM ID | 179035 |
| HGNC ID | 9721 |
| 基因别名 | P5C reductase 1, PYCR, P5CR, PRO3 |
基因功能与研究简介
PYCR1基因编码吡咯啉-5-羧酸还原酶1(P5C reductase 1),该酶催化吡咯啉-5-羧酸(P5C)还原为脯氨酸,是脯氨酸生物合成途径中的关键酶。脯氨酸在蛋白质合成、细胞氧化还原平衡、细胞凋亡调控等过程中发挥重要作用。PYCR1在多种组织中表达,尤其在皮肤、骨骼和肾脏中高表达。PYCR1基因突变可导致常染色体隐性遗传性皮肤松弛症(autosomal recessive cutis laxa type 2B),表现为皮肤松弛、关节过度活动、发育迟缓等。此外,PYCR1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤代谢重编程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 皮肤松弛症2B型 | PYCR1基因突变导致脯氨酸合成减少,影响胶原蛋白和弹性蛋白的合成与交联,导致皮肤松弛等结缔组织异常。 | 已明确致病 |
| 癌症 | PYCR1在多种肿瘤中高表达,可能通过促进脯氨酸合成支持肿瘤细胞增殖和存活,但具体机制尚在研究中。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.632G>A (p.Arg211Gln) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性,导致功能丧失 |
| c.424C>T (p.Arg142Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致PYCR1酶活性降低或缺失,影响脯氨酸合成,与皮肤松弛症相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004735 (pyrroline-5-carboxylate reductase activity) | • GO:0006561 (proline biosynthetic process) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
相关通路
• Proline biosynthesis (Reactome: R-HSA-70614)
• Metabolic reprogramming in cancer (KEGG: hsa05200)
蛋白质功能简介
PYCR1蛋白属于吡咯啉-5-羧酸还原酶家族,以同源二聚体形式存在,催化P5C还原为脯氨酸,利用NAD(P)H作为辅因子。该蛋白定位于细胞质,在脯氨酸合成中起关键作用。PYCR1在多种组织中表达,其表达水平受细胞代谢状态调控。在癌症中,PYCR1表达上调,可能通过促进脯氨酸合成支持肿瘤生长。