PYDC1基因|基因功能、疾病关联、突变与炎症研究

PYDC1编码ASC样蛋白,参与炎症小体调控,与自身炎症性疾病和感染免疫相关。

基因信息卡

基因符号 PYDC1
基因全名 PYD (pyrin domain) containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 16p11.2
NCBI Gene ID 26060 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26060
Ensembl ID ENSG00000161944
UniProt ID Q8WXU2
OMIM ID 606074
HGNC ID 17917
基因别名 ASC2, PYD1, POP1

基因功能与研究简介

PYDC1基因编码含pyrin结构域的蛋白1(PYD-containing protein 1),也称为ASC2或POP1。该蛋白含有pyrin结构域,但缺乏caspase招募结构域(CARD),因此可能作为炎症小体信号通路的负调控因子,通过与ASC竞争结合来抑制炎症小体组装和IL-1β的产生。PYDC1在免疫细胞中表达,参与调控炎症反应,与多种炎症性疾病和感染免疫相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
自身炎症性疾病 PYDC1可能通过调控炎症小体活性参与自身炎症性疾病的发病机制,但具体证据尚不充分。 暂无明确证据
感染性疾病 PYDC1表达变化可能影响宿主对病原体的免疫应答,但具体关联需进一步研究。 暂无明确证据
癌症 有研究表明PYDC1在肿瘤微环境中的表达可能影响炎症反应,但直接致病证据不足。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
U937 暂无可靠数据 单核细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs1435479 SNV 未知 可能影响基因表达,但功能影响未明确
rs1157915 SNV 未知 可能影响蛋白结构,但功能影响未明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致PYDC1蛋白表达减少或功能丧失,从而减弱对炎症小体的抑制作用,可能增强炎症反应。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强PYDC1的抑制活性,但尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰野生型PYDC1的功能,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005829 cytosol • GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• GO:0050728 negative regulation of inflammatory response

相关通路

NOD-like receptor signaling pathway (hsa04621)
Inflammasome pathway (hsa04621)

蛋白质功能简介

PYDC1蛋白由PYD结构域组成,缺乏CARD结构域,属于pyrin结构域家族。该蛋白主要定位于细胞质,可能通过PYD-PYD相互作用与ASC结合,竞争性抑制ASC与NLRP3等炎症小体传感器的结合,从而负调控炎症小体组装和IL-1β的成熟。PYDC1在免疫细胞中表达,参与调控炎症反应,其异常表达可能与炎症性疾病相关。

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