PYDC2基因|基因功能、疾病关联、突变与炎症研究

PYDC2编码PYD结构域蛋白,参与炎症小体调控,与自身炎症性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PYDC2
基因全名 PYD (pyrin domain) containing 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q28
NCBI Gene ID 132612 ncbi.nlm.nih.gov/gene/132612
Ensembl ID ENSG00000163823
UniProt ID Q8N2K0
OMIM ID 614252
HGNC ID 26520
基因别名 POP2, ASC2, PYD-containing protein 2

基因功能与研究简介

PYDC2基因编码PYD结构域蛋白2(PYD-containing protein 2),属于PYD家族成员。该蛋白通过其PYD结构域与ASC(apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD)相互作用,抑制炎症小体复合物的组装,从而负调控炎症反应。PYDC2在多种免疫细胞中表达,参与调控IL-1β和IL-18的成熟与分泌。研究表明,PYDC2的异常表达或突变可能与自身炎症性疾病和感染易感性相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
自身炎症性疾病 PYDC2通过抑制炎症小体活性,其功能缺失可能导致炎症过度激活,与自身炎症性疾病相关。 ClinVar, OMIM
感染性疾病 PYDC2表达下调可能增强炎症反应,影响病原体清除,与感染易感性相关。 PubMed
癌症 PYDC2在肿瘤微环境中的表达可能影响炎症相关肿瘤的发生发展,但证据有限。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无
外周血 暂无可靠数据 暂无
骨髓 暂无可靠数据 暂无
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
U937 暂无可靠数据 单核细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能缺失
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 罕见 可能影响PYD结构域功能,导致炎症抑制能力下降
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变可能导致PYDC2抑制炎症小体的能力减弱,从而增强炎症反应。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PYDC2存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PYDC2突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0032991 (protein-containing complex)
• GO:0043123 (positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling) • GO:0050728 (negative regulation of inflammatory response)

相关通路

NOD-like receptor signaling pathway (hsa04621)
Inflammasome pathway (hsa04621)

蛋白质功能简介

PYDC2蛋白由PYD结构域组成,属于PYD家族。该蛋白通过PYD-PYD相互作用与ASC结合,竞争性抑制ASC与NLRP3等炎症小体传感器的结合,从而阻断炎症小体复合物的形成,减少caspase-1的激活和IL-1β/IL-18的成熟。PYDC2在调节炎症反应中发挥关键作用,其表达水平的变化可能影响炎症相关疾病的发生。

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