RAB23基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RAB23是调控囊泡运输和细胞信号通路的关键小GTP酶,其突变与Carpenter综合征等发育疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 RAB23
基因全名 RAB23, member RAS oncogene family
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p12.1
NCBI Gene ID 51715 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51715
Ensembl ID ENSG00000112210
UniProt ID Q9ULC3
OMIM ID 606144
HGNC ID 14263
基因别名 HSPC137

基因功能与研究简介

RAB23基因编码Ras相关GTP酶家族成员,定位于6号染色体短臂1区2带1亚带(6p12.1)。该蛋白参与细胞内囊泡运输的调控,并在多种信号通路中发挥作用,特别是通过负调控Hedgehog信号通路影响胚胎发育。RAB23的功能异常与Carpenter综合征(一种罕见的常染色体隐性遗传病)密切相关,该疾病以颅缝早闭、多指(趾)畸形和肥胖等为特征。此外,RAB23在多种癌症中的异常表达提示其可能参与肿瘤发生发展,但具体机制尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Carpenter综合征 RAB23基因纯合或复合杂合突变导致功能丧失,影响Hedgehog信号通路的正常调控,进而导致颅缝早闭、多指(趾)畸形等发育异常。 已明确致病
癌症(多种类型) RAB23在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞增殖、凋亡和迁移参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.433C>T (p.Arg145*) 无义突变 罕见 Loss of Function(功能丧失)
c.554G>A (p.Trp185*) 无义突变 罕见 Loss of Function(功能丧失)
c.679_680del (p.Leu227Valfs*3) 移码突变 罕见 Loss of Function(功能丧失)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失):突变导致RAB23蛋白功能缺失或显著降低,常见于无义突变、移码突变等,是Carpenter综合征的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明RAB23存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明RAB23突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003924 (GTPase activity) • GO:0005525 (GTP binding)
• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0007224 (smoothened signaling pathway)
• GO:0015031 (protein transport) • GO:0016192 (vesicle-mediated transport)

相关通路

Hedgehog signaling pathway (hsa04340)

蛋白质功能简介

RAB23蛋白属于Ras超家族的小GTP酶,包含保守的GTP结合结构域和C端异戊二烯化位点,后者对于膜锚定和功能至关重要。RAB23在细胞内膜运输中发挥作用,并负调控Hedgehog信号通路,该通路在胚胎发育和细胞分化中起关键作用。RAB23的功能缺失突变导致Hedgehog信号过度激活,从而引发Carpenter综合征。此外,RAB23可能参与纤毛运输和细胞自噬等过程,但具体机制仍在研究中。

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