RAB38基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

RAB38是调控黑色素生成和血小板分泌的关键小GTP酶,其突变与Hermansky-Pudlak综合征相关。

基因信息卡

基因符号 RAB38
基因全名 RAB38, member RAS oncogene family
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q14.2
NCBI Gene ID 23682 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23682
Ensembl ID ENSG00000123892
UniProt ID P57729
OMIM ID 606290
HGNC ID 9776
基因别名 NY-MEL-1, RAB38, member RAS oncogene family

基因功能与研究简介

RAB38属于Ras相关小GTP酶家族,定位于溶酶体相关细胞器,主要参与黑色素细胞和血小板中细胞器的生物发生和运输。RAB38通过调控GTP/GDP转换,影响黑色素生成和血小板致密颗粒分泌。其突变可导致Hermansky-Pudlak综合征,表现为白化病和出血倾向。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Hermansky-Pudlak综合征 RAB38突变导致溶酶体相关细胞器生物发生异常,影响黑色素和血小板致密颗粒的形成,引起白化病和出血倾向。 已明确致病
黑色素瘤 RAB38在黑色素瘤中高表达,可能参与肿瘤进展,但具体机制尚不明确。 潜在关联
血小板储存池缺陷 RAB38功能缺失导致血小板致密颗粒减少,引起出血倾向。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
黑色素细胞 暂无可靠数据 RAB38高表达
血小板 暂无可靠数据 RAB38表达
黑色素瘤细胞系 暂无可靠数据 RAB38高表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.724C>T (p.Arg242Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.433G>A (p.Gly145Arg) 错义突变 罕见 可能影响GTP结合,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型):突变导致RAB38蛋白功能缺失或降低,如无义突变引起的截短蛋白。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明RAB38存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明RAB38突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003924 GTPase activity • GO:0005525 GTP binding
• GO:0006886 intracellular protein transport • GO:0032438 melanosome organization
• GO:0042470 melanosome

相关通路

RAB38 regulates melanosome biogenesis (Reactome: R-HSA-432722)
Platelet degranulation (Reactome: R-HSA-114608)

蛋白质功能简介

RAB38蛋白属于小GTP酶家族,包含GTP结合域和GTP水解域,通过结合GTP/GDP在活性与非活性状态间转换。RAB38主要定位于黑色素体和血小板致密颗粒,调控这些细胞器的生物发生和运输。其功能异常与Hermansky-Pudlak综合征相关。

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