RAD50基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RAD50是DNA双链断裂修复的关键因子,其突变与多种遗传性癌症易感综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RAD50 |
|---|---|
| 基因全名 | RAD50 double strand break repair protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q31.1 |
| NCBI Gene ID | 10111 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10111 |
| Ensembl ID | ENSG00000113522 |
| UniProt ID | Q92878 |
| OMIM ID | 604040 |
| HGNC ID | 9816 |
| 基因别名 | NBSLD, hRAD50 |
基因功能与研究简介
RAD50基因编码一种与MRE11和NBN共同形成MRN复合物的蛋白质,该复合物在DNA双链断裂的感知、信号传导和修复中发挥核心作用。RAD50具有ATP酶活性,参与DNA末端加工和同源重组修复。其功能缺陷会导致基因组不稳定,与多种遗传性疾病和癌症易感性相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Nijmegen断裂综合征样疾病 | 致病机制:RAD50双等位基因功能缺失突变导致MRN复合物功能受损,影响DNA修复和细胞周期检查点,导致基因组不稳定。 | 证据:OMIM 604040;ClinVar |
| 乳腺癌 | 致病机制:RAD50基因的截短突变(如c.687delT)可能增加乳腺癌风险,通过影响DNA修复能力。 | 证据:ClinVar;多项病例对照研究(PMID: 17393301) |
| 卵巢癌 | 致病机制:RAD50突变可能通过影响同源重组修复,增加卵巢癌风险。 | 证据:ClinVar;研究(PMID: 21779515) |
| 结直肠癌 | 致病机制:RAD50基因多态性可能与结直肠癌易感性相关,但证据尚不充分。 | 证据:研究(PMID: 23348503) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.687delT | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能缺失 |
| p.Arg633Ter | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能缺失 |
| p.Arg738His | 错义突变 | 罕见 | 可能影响ATP酶活性,功能部分受损 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变:如截短突变,导致RAD50蛋白功能丧失,影响DNA修复。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005524 ATP binding |
| • GO:0006310 homologous recombination | • GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination |
| • GO:0032508 DNA duplex unwinding |
相关通路
• Homologous recombination (hsa03440)
• Non-homologous end-joining (hsa03450)
• Fanconi anemia pathway (hsa03460)
蛋白质功能简介
RAD50蛋白是MRN复合物的核心组分,具有ATP酶活性,参与DNA双链断裂的识别和修复。它通过与MRE11和NBN相互作用,促进DNA末端加工和同源重组修复。RAD50的突变会导致基因组不稳定,增加癌症风险。