RAG2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RAG2是V(D)J重组的关键因子,其突变导致严重联合免疫缺陷,是免疫学与基因治疗研究的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 RAG2
基因全名 recombination activating gene 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 11p12
NCBI Gene ID 5897 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5897
Ensembl ID ENSG00000175097
UniProt ID P55895
OMIM ID 179616
HGNC ID 9832
基因别名 RAG-2

基因功能与研究简介

RAG2基因编码重组激活基因2蛋白,是V(D)J重组过程中的关键酶之一。RAG2与RAG1共同组成RAG复合物,在淋巴细胞发育早期识别并切割DNA,启动免疫球蛋白和T细胞受体的基因重排。RAG2的突变会导致V(D)J重组缺陷,进而引发严重联合免疫缺陷(SCID)等疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
严重联合免疫缺陷(SCID) RAG2基因突变导致V(D)J重组缺陷,使T细胞和B细胞发育受阻,引起严重的免疫缺陷。 已明确致病
Omenn综合征 RAG2基因部分功能保留的突变可导致Omenn综合征,表现为红皮病、淋巴结肿大和嗜酸性粒细胞增多等。 已明确致病
联合免疫缺陷(CID) RAG2基因突变也可导致较轻的联合免疫缺陷,表现为反复感染和自身免疫现象。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胸腺 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 高表达
淋巴结 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
Ramos 暂无可靠数据 Burkitt淋巴瘤细胞系
Nalm6 暂无可靠数据 B细胞前体白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.368C>T (p.Pro123Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.217C>T (p.Arg73Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.1184delA (p.Asn395ThrfsTer2) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变、移码突变,导致RAG2蛋白功能缺失,无法进行V(D)J重组。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明RAG2存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能具有显性负效应,干扰RAG复合物的正常功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0004519 endonuclease activity
• GO:0006310 DNA recombination • GO:0005634 nucleus

相关通路

V(D)J recombination (R-HSA-202430)
Immune System (R-HSA-168256)

蛋白质功能简介

RAG2蛋白由527个氨基酸组成,包含一个非典型植物同源结构域(PHD)和一个酸性区域。RAG2与RAG1形成复合物,识别重组信号序列(RSS)并切割DNA,产生双链断裂,启动V(D)J重组。RAG2的PHD结构域可结合组蛋白H3K4me3,调节重组活性。

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