RALY基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RALY作为RNA结合蛋白,参与RNA加工和基因表达调控,与多种癌症及自身免疫疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RALY |
|---|---|
| 基因全名 | RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20q11.23 |
| NCBI Gene ID | 22913 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22913 |
| Ensembl ID | ENSG00000125970 |
| UniProt ID | Q9UKM9 |
| OMIM ID | 604171 |
| HGNC ID | 9839 |
| 基因别名 | HNRPCL3, hnRNP-associated with lethal yellow, RALY, RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein |
基因功能与研究简介
RALY基因编码一种RNA结合蛋白,属于hnRNP家族。该蛋白参与前体mRNA的加工、转运和翻译调控,在基因表达调控中发挥重要作用。RALY在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,RALY与多种疾病相关,包括癌症和自身免疫疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | RALY在肝细胞癌中高表达,可能通过调控基因表达促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | RALY在结直肠癌中表达上调,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 系统性红斑狼疮 | RALY可能作为自身抗原参与系统性红斑狼疮的发病。 | 潜在关联 |
| 多发性硬化 | RALY表达异常可能与多发性硬化的发病有关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.R152W) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RNA结合能力 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致RALY蛋白功能丧失,影响RNA加工和基因表达调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强RALY的致癌活性,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常RALY蛋白的功能,导致细胞功能异常。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006397 mRNA processing | • GO:0008380 RNA splicing |
相关通路
• Pathway: hsa03040 Spliceosome
• Pathway: hsa03018 RNA degradation
蛋白质功能简介
RALY蛋白属于hnRNP家族,包含一个RNA识别基序(RRM),能够结合RNA,参与前体mRNA的加工、转运和翻译调控。该蛋白在细胞核中定位,与剪接体复合物相互作用,影响基因表达。RALY在多种肿瘤中高表达,可能通过调控癌基因或抑癌基因的表达促进肿瘤发生。
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